Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC103Q8IW40 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC103Q8IW40 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC103Q8IW40 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC103Q8IW40 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC103Q8IW40 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC103Q8IW40 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC103Q8IW40 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC103Q8IW40 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC103Q8IW40 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC103Q8IW40 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC103Q8IW40 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC103Q8IW40 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC103Q8IW40 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC103Q8IW40 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC103Q8IW40 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC103Q8IW40 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC103Q8IW40 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC103Q8IW40 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC103Q8IW40 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC103Q8IW40 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC103Q8IW40 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC103Q8IW40 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC103Q8IW40 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC103Q8IW40 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC103Q8IW40 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC103Q8IW40 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC103Q8IW40 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC103Q8IW40 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC103Q8IW40 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC103Q8IW40 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC103Q8IW40 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC103Q8IW40 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC103Q8IW40 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC103Q8IW40 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC103Q8IW40 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC103Q8IW40 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC103Q8IW40 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC103Q8IW40 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC103Q8IW40 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC103Q8IW40 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC103Q8IW40 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC103Q8IW40 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC103Q8IW40 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC103Q8IW40 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC103Q8IW40 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC103Q8IW40 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC103Q8IW40 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC103Q8IW40 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC103Q8IW40 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC103Q8IW40 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC103Q8IW40 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC103Q8IW40 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC103Q8IW40 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC103Q8IW40 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC103Q8IW40 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC103Q8IW40 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC103Q8IW40 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC103Q8IW40 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC103Q8IW40 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC103Q8IW40 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC103Q8IW40 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC103Q8IW40 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC103Q8IW40 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC103Q8IW40 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC103Q8IW40 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC103Q8IW40 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC103Q8IW40 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC103Q8IW40 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC103Q8IW40 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC103Q8IW40 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC103Q8IW40 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC103Q8IW40 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC103Q8IW40 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC103Q8IW40 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC103Q8IW40 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC103Q8IW40 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC103Q8IW40 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC103Q8IW40 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC103Q8IW40 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC103Q8IW40 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC103Q8IW40 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC103Q8IW40 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC103Q8IW40 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC103Q8IW40 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC103Q8IW40 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC103Q8IW40 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC103Q8IW40 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC103Q8IW40 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC103Q8IW40 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC103Q8IW40 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC103Q8IW40 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC103Q8IW40 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC103Q8IW40 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC103Q8IW40 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC103Q8IW40 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC103Q8IW40 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC103Q8IW40 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC103Q8IW40 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC103Q8IW40 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms