Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW00

VSTM4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4Q8IW00 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VSTM4Q8IW00 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VSTM4Q8IW00 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VSTM4Q8IW00 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VSTM4Q8IW00 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VSTM4Q8IW00 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VSTM4Q8IW00 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VSTM4Q8IW00 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
VSTM4Q8IW00 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VSTM4Q8IW00 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VSTM4Q8IW00 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VSTM4Q8IW00 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VSTM4Q8IW00 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VSTM4Q8IW00 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VSTM4Q8IW00 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VSTM4Q8IW00 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VSTM4Q8IW00 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VSTM4Q8IW00 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VSTM4Q8IW00 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VSTM4Q8IW00 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VSTM4Q8IW00 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VSTM4Q8IW00 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VSTM4Q8IW00 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VSTM4Q8IW00 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VSTM4Q8IW00 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VSTM4Q8IW00 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VSTM4Q8IW00 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VSTM4Q8IW00 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VSTM4Q8IW00 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VSTM4Q8IW00 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VSTM4Q8IW00 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
VSTM4Q8IW00 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VSTM4Q8IW00 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
VSTM4Q8IW00 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
VSTM4Q8IW00 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VSTM4Q8IW00 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VSTM4Q8IW00 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
VSTM4Q8IW00 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VSTM4Q8IW00 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VSTM4Q8IW00 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VSTM4Q8IW00 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VSTM4Q8IW00 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VSTM4Q8IW00 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VSTM4Q8IW00 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VSTM4Q8IW00 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VSTM4Q8IW00 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VSTM4Q8IW00 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VSTM4Q8IW00 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VSTM4Q8IW00 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VSTM4Q8IW00 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VSTM4Q8IW00 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VSTM4Q8IW00 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VSTM4Q8IW00 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VSTM4Q8IW00 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VSTM4Q8IW00 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VSTM4Q8IW00 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VSTM4Q8IW00 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VSTM4Q8IW00 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VSTM4Q8IW00 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VSTM4Q8IW00 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VSTM4Q8IW00 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VSTM4Q8IW00 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VSTM4Q8IW00 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VSTM4Q8IW00 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VSTM4Q8IW00 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VSTM4Q8IW00 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VSTM4Q8IW00 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VSTM4Q8IW00 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VSTM4Q8IW00 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VSTM4Q8IW00 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VSTM4Q8IW00 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VSTM4Q8IW00 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VSTM4Q8IW00 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VSTM4Q8IW00 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VSTM4Q8IW00 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VSTM4Q8IW00 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VSTM4Q8IW00 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VSTM4Q8IW00 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VSTM4Q8IW00 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VSTM4Q8IW00 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VSTM4Q8IW00 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VSTM4Q8IW00 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VSTM4Q8IW00 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VSTM4Q8IW00 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VSTM4Q8IW00 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VSTM4Q8IW00 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VSTM4Q8IW00 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VSTM4Q8IW00 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VSTM4Q8IW00 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VSTM4Q8IW00 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VSTM4Q8IW00 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VSTM4Q8IW00 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VSTM4Q8IW00 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VSTM4Q8IW00 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VSTM4Q8IW00 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VSTM4Q8IW00 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VSTM4Q8IW00 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VSTM4Q8IW00 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VSTM4Q8IW00 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VSTM4Q8IW00 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms