Protein–RNA interactions for Protein: Q86XK3

SFR1, Swi5-dependent recombination DNA repair protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFR1Q86XK3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SFR1Q86XK3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SFR1Q86XK3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SFR1Q86XK3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SFR1Q86XK3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SFR1Q86XK3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SFR1Q86XK3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SFR1Q86XK3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SFR1Q86XK3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SFR1Q86XK3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SFR1Q86XK3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SFR1Q86XK3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SFR1Q86XK3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SFR1Q86XK3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SFR1Q86XK3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SFR1Q86XK3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SFR1Q86XK3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SFR1Q86XK3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SFR1Q86XK3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SFR1Q86XK3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SFR1Q86XK3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SFR1Q86XK3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SFR1Q86XK3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SFR1Q86XK3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SFR1Q86XK3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SFR1Q86XK3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SFR1Q86XK3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SFR1Q86XK3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SFR1Q86XK3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SFR1Q86XK3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SFR1Q86XK3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SFR1Q86XK3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SFR1Q86XK3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SFR1Q86XK3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SFR1Q86XK3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SFR1Q86XK3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SFR1Q86XK3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SFR1Q86XK3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SFR1Q86XK3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SFR1Q86XK3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SFR1Q86XK3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SFR1Q86XK3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SFR1Q86XK3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SFR1Q86XK3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SFR1Q86XK3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SFR1Q86XK3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SFR1Q86XK3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SFR1Q86XK3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SFR1Q86XK3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SFR1Q86XK3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SFR1Q86XK3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SFR1Q86XK3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SFR1Q86XK3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SFR1Q86XK3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SFR1Q86XK3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SFR1Q86XK3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SFR1Q86XK3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SFR1Q86XK3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SFR1Q86XK3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SFR1Q86XK3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SFR1Q86XK3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SFR1Q86XK3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SFR1Q86XK3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SFR1Q86XK3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SFR1Q86XK3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SFR1Q86XK3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SFR1Q86XK3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SFR1Q86XK3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SFR1Q86XK3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SFR1Q86XK3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SFR1Q86XK3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SFR1Q86XK3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SFR1Q86XK3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SFR1Q86XK3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SFR1Q86XK3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SFR1Q86XK3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SFR1Q86XK3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SFR1Q86XK3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SFR1Q86XK3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SFR1Q86XK3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SFR1Q86XK3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SFR1Q86XK3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SFR1Q86XK3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SFR1Q86XK3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SFR1Q86XK3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SFR1Q86XK3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SFR1Q86XK3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SFR1Q86XK3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SFR1Q86XK3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SFR1Q86XK3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SFR1Q86XK3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SFR1Q86XK3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SFR1Q86XK3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SFR1Q86XK3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SFR1Q86XK3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SFR1Q86XK3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SFR1Q86XK3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SFR1Q86XK3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SFR1Q86XK3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SFR1Q86XK3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms