Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALYREFQ86V81 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALYREFQ86V81 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALYREFQ86V81 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALYREFQ86V81 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ALYREFQ86V81 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALYREFQ86V81 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ALYREFQ86V81 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ALYREFQ86V81 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ALYREFQ86V81 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALYREFQ86V81 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALYREFQ86V81 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ALYREFQ86V81 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ALYREFQ86V81 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALYREFQ86V81 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALYREFQ86V81 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALYREFQ86V81 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALYREFQ86V81 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ALYREFQ86V81 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ALYREFQ86V81 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALYREFQ86V81 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALYREFQ86V81 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALYREFQ86V81 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALYREFQ86V81 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALYREFQ86V81 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALYREFQ86V81 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALYREFQ86V81 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALYREFQ86V81 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALYREFQ86V81 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALYREFQ86V81 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALYREFQ86V81 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALYREFQ86V81 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALYREFQ86V81 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALYREFQ86V81 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALYREFQ86V81 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALYREFQ86V81 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALYREFQ86V81 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALYREFQ86V81 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ALYREFQ86V81 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALYREFQ86V81 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALYREFQ86V81 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALYREFQ86V81 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALYREFQ86V81 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALYREFQ86V81 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALYREFQ86V81 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALYREFQ86V81 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALYREFQ86V81 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALYREFQ86V81 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALYREFQ86V81 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALYREFQ86V81 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALYREFQ86V81 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALYREFQ86V81 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALYREFQ86V81 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALYREFQ86V81 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALYREFQ86V81 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALYREFQ86V81 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALYREFQ86V81 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALYREFQ86V81 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALYREFQ86V81 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALYREFQ86V81 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALYREFQ86V81 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALYREFQ86V81 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALYREFQ86V81 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALYREFQ86V81 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALYREFQ86V81 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALYREFQ86V81 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALYREFQ86V81 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALYREFQ86V81 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ALYREFQ86V81 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALYREFQ86V81 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALYREFQ86V81 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALYREFQ86V81 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALYREFQ86V81 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALYREFQ86V81 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALYREFQ86V81 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALYREFQ86V81 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALYREFQ86V81 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ALYREFQ86V81 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALYREFQ86V81 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALYREFQ86V81 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALYREFQ86V81 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALYREFQ86V81 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALYREFQ86V81 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALYREFQ86V81 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALYREFQ86V81 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALYREFQ86V81 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALYREFQ86V81 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALYREFQ86V81 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALYREFQ86V81 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALYREFQ86V81 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALYREFQ86V81 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALYREFQ86V81 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALYREFQ86V81 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALYREFQ86V81 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALYREFQ86V81 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ALYREFQ86V81 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALYREFQ86V81 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALYREFQ86V81 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALYREFQ86V81 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ALYREFQ86V81 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms