Protein–RNA interactions for Protein: Q86V59

PNMA8A, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8AQ86V59 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PNMA8AQ86V59 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PNMA8AQ86V59 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PNMA8AQ86V59 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PNMA8AQ86V59 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PNMA8AQ86V59 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PNMA8AQ86V59 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PNMA8AQ86V59 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PNMA8AQ86V59 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PNMA8AQ86V59 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PNMA8AQ86V59 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PNMA8AQ86V59 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PNMA8AQ86V59 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PNMA8AQ86V59 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PNMA8AQ86V59 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PNMA8AQ86V59 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PNMA8AQ86V59 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PNMA8AQ86V59 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PNMA8AQ86V59 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PNMA8AQ86V59 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PNMA8AQ86V59 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PNMA8AQ86V59 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PNMA8AQ86V59 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PNMA8AQ86V59 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PNMA8AQ86V59 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PNMA8AQ86V59 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PNMA8AQ86V59 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PNMA8AQ86V59 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PNMA8AQ86V59 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PNMA8AQ86V59 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PNMA8AQ86V59 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PNMA8AQ86V59 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PNMA8AQ86V59 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PNMA8AQ86V59 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PNMA8AQ86V59 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PNMA8AQ86V59 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PNMA8AQ86V59 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PNMA8AQ86V59 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PNMA8AQ86V59 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PNMA8AQ86V59 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PNMA8AQ86V59 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PNMA8AQ86V59 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PNMA8AQ86V59 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PNMA8AQ86V59 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PNMA8AQ86V59 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PNMA8AQ86V59 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PNMA8AQ86V59 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PNMA8AQ86V59 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PNMA8AQ86V59 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PNMA8AQ86V59 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PNMA8AQ86V59 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PNMA8AQ86V59 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PNMA8AQ86V59 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PNMA8AQ86V59 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PNMA8AQ86V59 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PNMA8AQ86V59 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PNMA8AQ86V59 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PNMA8AQ86V59 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PNMA8AQ86V59 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PNMA8AQ86V59 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PNMA8AQ86V59 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PNMA8AQ86V59 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PNMA8AQ86V59 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PNMA8AQ86V59 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PNMA8AQ86V59 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PNMA8AQ86V59 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PNMA8AQ86V59 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PNMA8AQ86V59 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PNMA8AQ86V59 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PNMA8AQ86V59 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PNMA8AQ86V59 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PNMA8AQ86V59 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PNMA8AQ86V59 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PNMA8AQ86V59 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PNMA8AQ86V59 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PNMA8AQ86V59 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PNMA8AQ86V59 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PNMA8AQ86V59 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PNMA8AQ86V59 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PNMA8AQ86V59 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PNMA8AQ86V59 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PNMA8AQ86V59 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PNMA8AQ86V59 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PNMA8AQ86V59 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PNMA8AQ86V59 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PNMA8AQ86V59 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PNMA8AQ86V59 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PNMA8AQ86V59 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PNMA8AQ86V59 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PNMA8AQ86V59 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PNMA8AQ86V59 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PNMA8AQ86V59 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PNMA8AQ86V59 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PNMA8AQ86V59 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PNMA8AQ86V59 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PNMA8AQ86V59 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PNMA8AQ86V59 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PNMA8AQ86V59 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PNMA8AQ86V59 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PNMA8AQ86V59 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms