Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF550Q7Z398 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF550Q7Z398 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF550Q7Z398 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF550Q7Z398 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF550Q7Z398 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ZNF550Q7Z398 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF550Q7Z398 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF550Q7Z398 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF550Q7Z398 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF550Q7Z398 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF550Q7Z398 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF550Q7Z398 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF550Q7Z398 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF550Q7Z398 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF550Q7Z398 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF550Q7Z398 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF550Q7Z398 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF550Q7Z398 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF550Q7Z398 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF550Q7Z398 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF550Q7Z398 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF550Q7Z398 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF550Q7Z398 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF550Q7Z398 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF550Q7Z398 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF550Q7Z398 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF550Q7Z398 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZNF550Q7Z398 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF550Q7Z398 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF550Q7Z398 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF550Q7Z398 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF550Q7Z398 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF550Q7Z398 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF550Q7Z398 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF550Q7Z398 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF550Q7Z398 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF550Q7Z398 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNF550Q7Z398 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF550Q7Z398 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF550Q7Z398 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF550Q7Z398 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF550Q7Z398 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF550Q7Z398 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF550Q7Z398 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF550Q7Z398 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF550Q7Z398 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF550Q7Z398 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF550Q7Z398 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF550Q7Z398 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF550Q7Z398 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZNF550Q7Z398 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZNF550Q7Z398 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF550Q7Z398 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF550Q7Z398 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF550Q7Z398 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF550Q7Z398 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF550Q7Z398 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF550Q7Z398 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF550Q7Z398 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF550Q7Z398 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF550Q7Z398 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF550Q7Z398 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF550Q7Z398 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF550Q7Z398 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF550Q7Z398 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF550Q7Z398 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF550Q7Z398 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF550Q7Z398 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF550Q7Z398 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF550Q7Z398 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF550Q7Z398 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF550Q7Z398 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF550Q7Z398 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF550Q7Z398 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF550Q7Z398 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF550Q7Z398 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF550Q7Z398 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF550Q7Z398 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF550Q7Z398 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF550Q7Z398 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF550Q7Z398 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF550Q7Z398 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF550Q7Z398 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF550Q7Z398 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF550Q7Z398 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF550Q7Z398 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF550Q7Z398 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF550Q7Z398 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF550Q7Z398 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF550Q7Z398 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF550Q7Z398 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF550Q7Z398 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF550Q7Z398 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF550Q7Z398 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF550Q7Z398 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF550Q7Z398 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF550Q7Z398 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF550Q7Z398 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF550Q7Z398 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms