Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5L3

GDPD3, Lysophospholipase D GDPD3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD3Q7L5L3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GDPD3Q7L5L3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GDPD3Q7L5L3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GDPD3Q7L5L3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GDPD3Q7L5L3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GDPD3Q7L5L3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GDPD3Q7L5L3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GDPD3Q7L5L3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GDPD3Q7L5L3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GDPD3Q7L5L3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GDPD3Q7L5L3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GDPD3Q7L5L3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GDPD3Q7L5L3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GDPD3Q7L5L3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GDPD3Q7L5L3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GDPD3Q7L5L3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GDPD3Q7L5L3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GDPD3Q7L5L3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GDPD3Q7L5L3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GDPD3Q7L5L3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GDPD3Q7L5L3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GDPD3Q7L5L3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GDPD3Q7L5L3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GDPD3Q7L5L3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GDPD3Q7L5L3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDPD3Q7L5L3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDPD3Q7L5L3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDPD3Q7L5L3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDPD3Q7L5L3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDPD3Q7L5L3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDPD3Q7L5L3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDPD3Q7L5L3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDPD3Q7L5L3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDPD3Q7L5L3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDPD3Q7L5L3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDPD3Q7L5L3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDPD3Q7L5L3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDPD3Q7L5L3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDPD3Q7L5L3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDPD3Q7L5L3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDPD3Q7L5L3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GDPD3Q7L5L3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDPD3Q7L5L3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDPD3Q7L5L3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDPD3Q7L5L3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDPD3Q7L5L3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GDPD3Q7L5L3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDPD3Q7L5L3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDPD3Q7L5L3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDPD3Q7L5L3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDPD3Q7L5L3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDPD3Q7L5L3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDPD3Q7L5L3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDPD3Q7L5L3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDPD3Q7L5L3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDPD3Q7L5L3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDPD3Q7L5L3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDPD3Q7L5L3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDPD3Q7L5L3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDPD3Q7L5L3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDPD3Q7L5L3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDPD3Q7L5L3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDPD3Q7L5L3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDPD3Q7L5L3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDPD3Q7L5L3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDPD3Q7L5L3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDPD3Q7L5L3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDPD3Q7L5L3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDPD3Q7L5L3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDPD3Q7L5L3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDPD3Q7L5L3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDPD3Q7L5L3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDPD3Q7L5L3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GDPD3Q7L5L3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDPD3Q7L5L3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDPD3Q7L5L3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDPD3Q7L5L3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GDPD3Q7L5L3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDPD3Q7L5L3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDPD3Q7L5L3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDPD3Q7L5L3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDPD3Q7L5L3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDPD3Q7L5L3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDPD3Q7L5L3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDPD3Q7L5L3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDPD3Q7L5L3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDPD3Q7L5L3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDPD3Q7L5L3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDPD3Q7L5L3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDPD3Q7L5L3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDPD3Q7L5L3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDPD3Q7L5L3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDPD3Q7L5L3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDPD3Q7L5L3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDPD3Q7L5L3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GDPD3Q7L5L3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDPD3Q7L5L3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDPD3Q7L5L3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDPD3Q7L5L3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDPD3Q7L5L3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms