Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1I2

SV2B, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2BQ7L1I2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SV2BQ7L1I2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SV2BQ7L1I2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SV2BQ7L1I2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SV2BQ7L1I2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SV2BQ7L1I2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SV2BQ7L1I2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SV2BQ7L1I2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SV2BQ7L1I2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SV2BQ7L1I2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SV2BQ7L1I2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SV2BQ7L1I2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SV2BQ7L1I2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SV2BQ7L1I2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SV2BQ7L1I2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SV2BQ7L1I2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SV2BQ7L1I2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SV2BQ7L1I2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SV2BQ7L1I2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SV2BQ7L1I2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SV2BQ7L1I2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SV2BQ7L1I2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SV2BQ7L1I2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SV2BQ7L1I2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SV2BQ7L1I2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SV2BQ7L1I2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SV2BQ7L1I2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SV2BQ7L1I2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SV2BQ7L1I2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SV2BQ7L1I2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SV2BQ7L1I2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SV2BQ7L1I2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SV2BQ7L1I2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SV2BQ7L1I2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SV2BQ7L1I2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SV2BQ7L1I2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SV2BQ7L1I2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SV2BQ7L1I2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SV2BQ7L1I2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SV2BQ7L1I2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SV2BQ7L1I2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SV2BQ7L1I2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SV2BQ7L1I2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SV2BQ7L1I2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SV2BQ7L1I2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SV2BQ7L1I2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SV2BQ7L1I2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SV2BQ7L1I2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SV2BQ7L1I2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SV2BQ7L1I2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SV2BQ7L1I2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SV2BQ7L1I2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SV2BQ7L1I2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SV2BQ7L1I2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SV2BQ7L1I2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SV2BQ7L1I2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SV2BQ7L1I2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SV2BQ7L1I2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SV2BQ7L1I2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SV2BQ7L1I2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SV2BQ7L1I2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SV2BQ7L1I2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SV2BQ7L1I2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SV2BQ7L1I2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SV2BQ7L1I2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SV2BQ7L1I2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SV2BQ7L1I2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SV2BQ7L1I2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SV2BQ7L1I2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SV2BQ7L1I2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SV2BQ7L1I2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SV2BQ7L1I2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SV2BQ7L1I2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SV2BQ7L1I2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SV2BQ7L1I2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SV2BQ7L1I2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SV2BQ7L1I2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SV2BQ7L1I2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SV2BQ7L1I2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SV2BQ7L1I2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SV2BQ7L1I2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SV2BQ7L1I2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SV2BQ7L1I2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SV2BQ7L1I2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SV2BQ7L1I2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SV2BQ7L1I2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SV2BQ7L1I2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SV2BQ7L1I2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SV2BQ7L1I2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SV2BQ7L1I2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SV2BQ7L1I2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SV2BQ7L1I2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SV2BQ7L1I2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SV2BQ7L1I2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SV2BQ7L1I2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SV2BQ7L1I2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SV2BQ7L1I2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SV2BQ7L1I2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SV2BQ7L1I2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SV2BQ7L1I2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms