Protein–RNA interactions for Protein: Q712K3

UBE2R2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2R2Q712K3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2R2Q712K3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2R2Q712K3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2R2Q712K3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2R2Q712K3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2R2Q712K3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2R2Q712K3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2R2Q712K3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2R2Q712K3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2R2Q712K3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2R2Q712K3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2R2Q712K3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2R2Q712K3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2R2Q712K3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2R2Q712K3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2R2Q712K3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2R2Q712K3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2R2Q712K3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2R2Q712K3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2R2Q712K3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2R2Q712K3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2R2Q712K3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2R2Q712K3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2R2Q712K3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2R2Q712K3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2R2Q712K3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2R2Q712K3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2R2Q712K3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2R2Q712K3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2R2Q712K3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2R2Q712K3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2R2Q712K3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2R2Q712K3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2R2Q712K3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2R2Q712K3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2R2Q712K3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2R2Q712K3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2R2Q712K3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2R2Q712K3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2R2Q712K3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2R2Q712K3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2R2Q712K3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2R2Q712K3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2R2Q712K3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2R2Q712K3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2R2Q712K3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2R2Q712K3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2R2Q712K3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2R2Q712K3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2R2Q712K3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2R2Q712K3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2R2Q712K3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2R2Q712K3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2R2Q712K3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2R2Q712K3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2R2Q712K3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2R2Q712K3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2R2Q712K3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2R2Q712K3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2R2Q712K3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2R2Q712K3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2R2Q712K3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2R2Q712K3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2R2Q712K3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2R2Q712K3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2R2Q712K3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2R2Q712K3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2R2Q712K3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2R2Q712K3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2R2Q712K3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2R2Q712K3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2R2Q712K3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2R2Q712K3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBE2R2Q712K3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBE2R2Q712K3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2R2Q712K3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2R2Q712K3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2R2Q712K3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2R2Q712K3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2R2Q712K3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2R2Q712K3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2R2Q712K3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2R2Q712K3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2R2Q712K3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2R2Q712K3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2R2Q712K3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2R2Q712K3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2R2Q712K3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2R2Q712K3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2R2Q712K3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2R2Q712K3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2R2Q712K3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2R2Q712K3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2R2Q712K3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2R2Q712K3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2R2Q712K3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2R2Q712K3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2R2Q712K3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2R2Q712K3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2R2Q712K3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms