Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC149Q6ZUS6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC149Q6ZUS6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC149Q6ZUS6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC149Q6ZUS6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC149Q6ZUS6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC149Q6ZUS6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC149Q6ZUS6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC149Q6ZUS6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC149Q6ZUS6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC149Q6ZUS6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC149Q6ZUS6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC149Q6ZUS6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC149Q6ZUS6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC149Q6ZUS6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC149Q6ZUS6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC149Q6ZUS6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC149Q6ZUS6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC149Q6ZUS6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC149Q6ZUS6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC149Q6ZUS6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC149Q6ZUS6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC149Q6ZUS6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC149Q6ZUS6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC149Q6ZUS6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC149Q6ZUS6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC149Q6ZUS6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC149Q6ZUS6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC149Q6ZUS6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC149Q6ZUS6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC149Q6ZUS6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC149Q6ZUS6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC149Q6ZUS6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC149Q6ZUS6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC149Q6ZUS6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC149Q6ZUS6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC149Q6ZUS6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC149Q6ZUS6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC149Q6ZUS6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC149Q6ZUS6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC149Q6ZUS6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC149Q6ZUS6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC149Q6ZUS6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC149Q6ZUS6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC149Q6ZUS6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC149Q6ZUS6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC149Q6ZUS6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC149Q6ZUS6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC149Q6ZUS6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC149Q6ZUS6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC149Q6ZUS6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC149Q6ZUS6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC149Q6ZUS6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC149Q6ZUS6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC149Q6ZUS6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC149Q6ZUS6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC149Q6ZUS6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC149Q6ZUS6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC149Q6ZUS6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC149Q6ZUS6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC149Q6ZUS6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC149Q6ZUS6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC149Q6ZUS6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC149Q6ZUS6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC149Q6ZUS6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC149Q6ZUS6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC149Q6ZUS6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC149Q6ZUS6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC149Q6ZUS6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC149Q6ZUS6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC149Q6ZUS6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC149Q6ZUS6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC149Q6ZUS6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC149Q6ZUS6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC149Q6ZUS6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC149Q6ZUS6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC149Q6ZUS6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC149Q6ZUS6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC149Q6ZUS6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC149Q6ZUS6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC149Q6ZUS6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC149Q6ZUS6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC149Q6ZUS6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC149Q6ZUS6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC149Q6ZUS6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC149Q6ZUS6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC149Q6ZUS6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC149Q6ZUS6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC149Q6ZUS6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC149Q6ZUS6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC149Q6ZUS6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC149Q6ZUS6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC149Q6ZUS6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC149Q6ZUS6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC149Q6ZUS6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC149Q6ZUS6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC149Q6ZUS6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC149Q6ZUS6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC149Q6ZUS6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC149Q6ZUS6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms