Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TPGS1Q6ZTW0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TPGS1Q6ZTW0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TPGS1Q6ZTW0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TPGS1Q6ZTW0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TPGS1Q6ZTW0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TPGS1Q6ZTW0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TPGS1Q6ZTW0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TPGS1Q6ZTW0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TPGS1Q6ZTW0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TPGS1Q6ZTW0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TPGS1Q6ZTW0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TPGS1Q6ZTW0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TPGS1Q6ZTW0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TPGS1Q6ZTW0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TPGS1Q6ZTW0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TPGS1Q6ZTW0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TPGS1Q6ZTW0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TPGS1Q6ZTW0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TPGS1Q6ZTW0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TPGS1Q6ZTW0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TPGS1Q6ZTW0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TPGS1Q6ZTW0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TPGS1Q6ZTW0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TPGS1Q6ZTW0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TPGS1Q6ZTW0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TPGS1Q6ZTW0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPGS1Q6ZTW0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPGS1Q6ZTW0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPGS1Q6ZTW0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TPGS1Q6ZTW0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPGS1Q6ZTW0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPGS1Q6ZTW0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPGS1Q6ZTW0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPGS1Q6ZTW0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPGS1Q6ZTW0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPGS1Q6ZTW0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPGS1Q6ZTW0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPGS1Q6ZTW0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPGS1Q6ZTW0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPGS1Q6ZTW0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPGS1Q6ZTW0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPGS1Q6ZTW0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPGS1Q6ZTW0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TPGS1Q6ZTW0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TPGS1Q6ZTW0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TPGS1Q6ZTW0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TPGS1Q6ZTW0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TPGS1Q6ZTW0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TPGS1Q6ZTW0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TPGS1Q6ZTW0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TPGS1Q6ZTW0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TPGS1Q6ZTW0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TPGS1Q6ZTW0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TPGS1Q6ZTW0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TPGS1Q6ZTW0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TPGS1Q6ZTW0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TPGS1Q6ZTW0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TPGS1Q6ZTW0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TPGS1Q6ZTW0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TPGS1Q6ZTW0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TPGS1Q6ZTW0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TPGS1Q6ZTW0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPGS1Q6ZTW0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPGS1Q6ZTW0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPGS1Q6ZTW0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPGS1Q6ZTW0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPGS1Q6ZTW0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPGS1Q6ZTW0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPGS1Q6ZTW0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPGS1Q6ZTW0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPGS1Q6ZTW0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPGS1Q6ZTW0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPGS1Q6ZTW0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPGS1Q6ZTW0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPGS1Q6ZTW0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TPGS1Q6ZTW0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPGS1Q6ZTW0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPGS1Q6ZTW0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPGS1Q6ZTW0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPGS1Q6ZTW0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPGS1Q6ZTW0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPGS1Q6ZTW0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPGS1Q6ZTW0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TPGS1Q6ZTW0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TPGS1Q6ZTW0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TPGS1Q6ZTW0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TPGS1Q6ZTW0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TPGS1Q6ZTW0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TPGS1Q6ZTW0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TPGS1Q6ZTW0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TPGS1Q6ZTW0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TPGS1Q6ZTW0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TPGS1Q6ZTW0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TPGS1Q6ZTW0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TPGS1Q6ZTW0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TPGS1Q6ZTW0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TPGS1Q6ZTW0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TPGS1Q6ZTW0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TPGS1Q6ZTW0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.5 ms