Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNA4

RNF111, E3 ubiquitin-protein ligase Arkadia, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF111Q6ZNA4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF111Q6ZNA4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF111Q6ZNA4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF111Q6ZNA4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF111Q6ZNA4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF111Q6ZNA4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF111Q6ZNA4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF111Q6ZNA4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF111Q6ZNA4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF111Q6ZNA4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF111Q6ZNA4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF111Q6ZNA4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF111Q6ZNA4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF111Q6ZNA4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF111Q6ZNA4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF111Q6ZNA4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF111Q6ZNA4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF111Q6ZNA4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF111Q6ZNA4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF111Q6ZNA4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF111Q6ZNA4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF111Q6ZNA4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF111Q6ZNA4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF111Q6ZNA4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF111Q6ZNA4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF111Q6ZNA4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF111Q6ZNA4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF111Q6ZNA4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF111Q6ZNA4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF111Q6ZNA4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF111Q6ZNA4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF111Q6ZNA4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF111Q6ZNA4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF111Q6ZNA4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF111Q6ZNA4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF111Q6ZNA4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF111Q6ZNA4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF111Q6ZNA4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF111Q6ZNA4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF111Q6ZNA4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF111Q6ZNA4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF111Q6ZNA4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF111Q6ZNA4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF111Q6ZNA4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF111Q6ZNA4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF111Q6ZNA4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF111Q6ZNA4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF111Q6ZNA4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RNF111Q6ZNA4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF111Q6ZNA4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF111Q6ZNA4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF111Q6ZNA4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF111Q6ZNA4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF111Q6ZNA4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF111Q6ZNA4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF111Q6ZNA4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF111Q6ZNA4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF111Q6ZNA4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF111Q6ZNA4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF111Q6ZNA4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF111Q6ZNA4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF111Q6ZNA4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF111Q6ZNA4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF111Q6ZNA4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF111Q6ZNA4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF111Q6ZNA4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF111Q6ZNA4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF111Q6ZNA4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF111Q6ZNA4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF111Q6ZNA4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF111Q6ZNA4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF111Q6ZNA4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF111Q6ZNA4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF111Q6ZNA4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF111Q6ZNA4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF111Q6ZNA4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF111Q6ZNA4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF111Q6ZNA4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF111Q6ZNA4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF111Q6ZNA4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF111Q6ZNA4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF111Q6ZNA4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF111Q6ZNA4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF111Q6ZNA4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF111Q6ZNA4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF111Q6ZNA4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF111Q6ZNA4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF111Q6ZNA4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF111Q6ZNA4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF111Q6ZNA4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF111Q6ZNA4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF111Q6ZNA4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF111Q6ZNA4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF111Q6ZNA4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF111Q6ZNA4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF111Q6ZNA4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF111Q6ZNA4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF111Q6ZNA4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF111Q6ZNA4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF111Q6ZNA4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms