Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMZ3

SYNE3, Nesprin-3, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE3Q6ZMZ3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYNE3Q6ZMZ3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYNE3Q6ZMZ3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYNE3Q6ZMZ3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYNE3Q6ZMZ3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYNE3Q6ZMZ3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYNE3Q6ZMZ3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYNE3Q6ZMZ3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYNE3Q6ZMZ3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYNE3Q6ZMZ3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYNE3Q6ZMZ3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYNE3Q6ZMZ3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYNE3Q6ZMZ3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYNE3Q6ZMZ3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYNE3Q6ZMZ3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SYNE3Q6ZMZ3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYNE3Q6ZMZ3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYNE3Q6ZMZ3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYNE3Q6ZMZ3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYNE3Q6ZMZ3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SYNE3Q6ZMZ3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYNE3Q6ZMZ3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYNE3Q6ZMZ3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYNE3Q6ZMZ3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYNE3Q6ZMZ3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYNE3Q6ZMZ3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYNE3Q6ZMZ3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYNE3Q6ZMZ3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYNE3Q6ZMZ3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYNE3Q6ZMZ3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYNE3Q6ZMZ3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYNE3Q6ZMZ3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYNE3Q6ZMZ3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNE3Q6ZMZ3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNE3Q6ZMZ3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYNE3Q6ZMZ3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SYNE3Q6ZMZ3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYNE3Q6ZMZ3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SYNE3Q6ZMZ3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYNE3Q6ZMZ3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYNE3Q6ZMZ3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYNE3Q6ZMZ3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYNE3Q6ZMZ3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYNE3Q6ZMZ3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNE3Q6ZMZ3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNE3Q6ZMZ3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNE3Q6ZMZ3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNE3Q6ZMZ3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNE3Q6ZMZ3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNE3Q6ZMZ3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNE3Q6ZMZ3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNE3Q6ZMZ3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNE3Q6ZMZ3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNE3Q6ZMZ3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNE3Q6ZMZ3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNE3Q6ZMZ3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNE3Q6ZMZ3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYNE3Q6ZMZ3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYNE3Q6ZMZ3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNE3Q6ZMZ3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNE3Q6ZMZ3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNE3Q6ZMZ3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNE3Q6ZMZ3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNE3Q6ZMZ3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNE3Q6ZMZ3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNE3Q6ZMZ3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNE3Q6ZMZ3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNE3Q6ZMZ3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNE3Q6ZMZ3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNE3Q6ZMZ3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNE3Q6ZMZ3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNE3Q6ZMZ3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNE3Q6ZMZ3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNE3Q6ZMZ3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNE3Q6ZMZ3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNE3Q6ZMZ3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNE3Q6ZMZ3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNE3Q6ZMZ3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNE3Q6ZMZ3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNE3Q6ZMZ3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNE3Q6ZMZ3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYNE3Q6ZMZ3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYNE3Q6ZMZ3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYNE3Q6ZMZ3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYNE3Q6ZMZ3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYNE3Q6ZMZ3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYNE3Q6ZMZ3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYNE3Q6ZMZ3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYNE3Q6ZMZ3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYNE3Q6ZMZ3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYNE3Q6ZMZ3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYNE3Q6ZMZ3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYNE3Q6ZMZ3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYNE3Q6ZMZ3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SYNE3Q6ZMZ3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SYNE3Q6ZMZ3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms