Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM72Q6ZMU5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM72Q6ZMU5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM72Q6ZMU5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM72Q6ZMU5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM72Q6ZMU5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM72Q6ZMU5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM72Q6ZMU5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM72Q6ZMU5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM72Q6ZMU5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM72Q6ZMU5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM72Q6ZMU5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM72Q6ZMU5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM72Q6ZMU5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM72Q6ZMU5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM72Q6ZMU5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM72Q6ZMU5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM72Q6ZMU5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM72Q6ZMU5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM72Q6ZMU5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM72Q6ZMU5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM72Q6ZMU5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM72Q6ZMU5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM72Q6ZMU5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM72Q6ZMU5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM72Q6ZMU5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM72Q6ZMU5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM72Q6ZMU5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM72Q6ZMU5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM72Q6ZMU5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM72Q6ZMU5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM72Q6ZMU5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM72Q6ZMU5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM72Q6ZMU5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM72Q6ZMU5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM72Q6ZMU5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM72Q6ZMU5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM72Q6ZMU5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM72Q6ZMU5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM72Q6ZMU5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM72Q6ZMU5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRIM72Q6ZMU5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRIM72Q6ZMU5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM72Q6ZMU5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM72Q6ZMU5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM72Q6ZMU5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM72Q6ZMU5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM72Q6ZMU5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM72Q6ZMU5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM72Q6ZMU5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM72Q6ZMU5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM72Q6ZMU5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM72Q6ZMU5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM72Q6ZMU5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM72Q6ZMU5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM72Q6ZMU5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM72Q6ZMU5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM72Q6ZMU5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM72Q6ZMU5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM72Q6ZMU5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM72Q6ZMU5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM72Q6ZMU5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM72Q6ZMU5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM72Q6ZMU5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM72Q6ZMU5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM72Q6ZMU5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM72Q6ZMU5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM72Q6ZMU5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM72Q6ZMU5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM72Q6ZMU5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM72Q6ZMU5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM72Q6ZMU5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM72Q6ZMU5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM72Q6ZMU5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM72Q6ZMU5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM72Q6ZMU5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM72Q6ZMU5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM72Q6ZMU5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM72Q6ZMU5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM72Q6ZMU5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM72Q6ZMU5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM72Q6ZMU5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM72Q6ZMU5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM72Q6ZMU5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM72Q6ZMU5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM72Q6ZMU5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM72Q6ZMU5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM72Q6ZMU5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM72Q6ZMU5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM72Q6ZMU5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM72Q6ZMU5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM72Q6ZMU5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM72Q6ZMU5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM72Q6ZMU5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM72Q6ZMU5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM72Q6ZMU5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM72Q6ZMU5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM72Q6ZMU5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM72Q6ZMU5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM72Q6ZMU5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms