Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY09

CEACAM20, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 20, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM20Q6UY09 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEACAM20Q6UY09 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEACAM20Q6UY09 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEACAM20Q6UY09 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEACAM20Q6UY09 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEACAM20Q6UY09 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEACAM20Q6UY09 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEACAM20Q6UY09 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEACAM20Q6UY09 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEACAM20Q6UY09 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEACAM20Q6UY09 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEACAM20Q6UY09 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEACAM20Q6UY09 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEACAM20Q6UY09 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEACAM20Q6UY09 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEACAM20Q6UY09 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEACAM20Q6UY09 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CEACAM20Q6UY09 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CEACAM20Q6UY09 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CEACAM20Q6UY09 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEACAM20Q6UY09 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEACAM20Q6UY09 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEACAM20Q6UY09 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEACAM20Q6UY09 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEACAM20Q6UY09 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEACAM20Q6UY09 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CEACAM20Q6UY09 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEACAM20Q6UY09 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEACAM20Q6UY09 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEACAM20Q6UY09 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEACAM20Q6UY09 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEACAM20Q6UY09 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CEACAM20Q6UY09 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CEACAM20Q6UY09 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEACAM20Q6UY09 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEACAM20Q6UY09 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEACAM20Q6UY09 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEACAM20Q6UY09 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEACAM20Q6UY09 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEACAM20Q6UY09 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEACAM20Q6UY09 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEACAM20Q6UY09 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEACAM20Q6UY09 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEACAM20Q6UY09 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEACAM20Q6UY09 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEACAM20Q6UY09 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEACAM20Q6UY09 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEACAM20Q6UY09 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEACAM20Q6UY09 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEACAM20Q6UY09 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEACAM20Q6UY09 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEACAM20Q6UY09 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEACAM20Q6UY09 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEACAM20Q6UY09 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEACAM20Q6UY09 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEACAM20Q6UY09 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEACAM20Q6UY09 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEACAM20Q6UY09 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEACAM20Q6UY09 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEACAM20Q6UY09 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CEACAM20Q6UY09 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEACAM20Q6UY09 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEACAM20Q6UY09 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CEACAM20Q6UY09 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CEACAM20Q6UY09 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CEACAM20Q6UY09 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CEACAM20Q6UY09 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEACAM20Q6UY09 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEACAM20Q6UY09 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEACAM20Q6UY09 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEACAM20Q6UY09 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEACAM20Q6UY09 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEACAM20Q6UY09 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEACAM20Q6UY09 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEACAM20Q6UY09 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CEACAM20Q6UY09 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEACAM20Q6UY09 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEACAM20Q6UY09 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEACAM20Q6UY09 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEACAM20Q6UY09 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEACAM20Q6UY09 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CEACAM20Q6UY09 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CEACAM20Q6UY09 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CEACAM20Q6UY09 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CEACAM20Q6UY09 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CEACAM20Q6UY09 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CEACAM20Q6UY09 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEACAM20Q6UY09 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEACAM20Q6UY09 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEACAM20Q6UY09 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEACAM20Q6UY09 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEACAM20Q6UY09 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEACAM20Q6UY09 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CEACAM20Q6UY09 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEACAM20Q6UY09 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEACAM20Q6UY09 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEACAM20Q6UY09 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEACAM20Q6UY09 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEACAM20Q6UY09 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEACAM20Q6UY09 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms