Protein–RNA interactions for Protein: Q6PL18

ATAD2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD2Q6PL18 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ATAD2Q6PL18 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ATAD2Q6PL18 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ATAD2Q6PL18 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ATAD2Q6PL18 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ATAD2Q6PL18 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ATAD2Q6PL18 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ATAD2Q6PL18 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ATAD2Q6PL18 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ATAD2Q6PL18 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ATAD2Q6PL18 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ATAD2Q6PL18 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ATAD2Q6PL18 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
ATAD2Q6PL18 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC32.32■■■□□ 2.77
ATAD2Q6PL18 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC32.32■■■□□ 2.77
ATAD2Q6PL18 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ATAD2Q6PL18 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ATAD2Q6PL18 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ATAD2Q6PL18 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ATAD2Q6PL18 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ATAD2Q6PL18 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ATAD2Q6PL18 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ATAD2Q6PL18 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ATAD2Q6PL18 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ATAD2Q6PL18 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ATAD2Q6PL18 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
ATAD2Q6PL18 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ATAD2Q6PL18 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ATAD2Q6PL18 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ATAD2Q6PL18 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ATAD2Q6PL18 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ATAD2Q6PL18 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
ATAD2Q6PL18 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ATAD2Q6PL18 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ATAD2Q6PL18 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ATAD2Q6PL18 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ATAD2Q6PL18 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ATAD2Q6PL18 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ATAD2Q6PL18 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ATAD2Q6PL18 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ATAD2Q6PL18 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ATAD2Q6PL18 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ATAD2Q6PL18 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ATAD2Q6PL18 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
ATAD2Q6PL18 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ATAD2Q6PL18 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ATAD2Q6PL18 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ATAD2Q6PL18 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ATAD2Q6PL18 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ATAD2Q6PL18 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ATAD2Q6PL18 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ATAD2Q6PL18 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
ATAD2Q6PL18 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ATAD2Q6PL18 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ATAD2Q6PL18 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
ATAD2Q6PL18 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
ATAD2Q6PL18 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
ATAD2Q6PL18 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ATAD2Q6PL18 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ATAD2Q6PL18 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
ATAD2Q6PL18 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ATAD2Q6PL18 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ATAD2Q6PL18 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ATAD2Q6PL18 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ATAD2Q6PL18 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ATAD2Q6PL18 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ATAD2Q6PL18 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ATAD2Q6PL18 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ATAD2Q6PL18 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ATAD2Q6PL18 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ATAD2Q6PL18 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ATAD2Q6PL18 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ATAD2Q6PL18 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ATAD2Q6PL18 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ATAD2Q6PL18 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ATAD2Q6PL18 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ATAD2Q6PL18 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ATAD2Q6PL18 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ATAD2Q6PL18 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
ATAD2Q6PL18 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ATAD2Q6PL18 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ATAD2Q6PL18 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ATAD2Q6PL18 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ATAD2Q6PL18 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ATAD2Q6PL18 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ATAD2Q6PL18 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ATAD2Q6PL18 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
ATAD2Q6PL18 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ATAD2Q6PL18 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
ATAD2Q6PL18 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
ATAD2Q6PL18 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
ATAD2Q6PL18 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
ATAD2Q6PL18 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
ATAD2Q6PL18 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
ATAD2Q6PL18 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
ATAD2Q6PL18 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ATAD2Q6PL18 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ATAD2Q6PL18 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ATAD2Q6PL18 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ATAD2Q6PL18 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms