Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
KCNIP4Q6PIL6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNIP4Q6PIL6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms