Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBA3EQ6PEY2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBA3EQ6PEY2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBA3EQ6PEY2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBA3EQ6PEY2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBA3EQ6PEY2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBA3EQ6PEY2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBA3EQ6PEY2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBA3EQ6PEY2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBA3EQ6PEY2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBA3EQ6PEY2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBA3EQ6PEY2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBA3EQ6PEY2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBA3EQ6PEY2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBA3EQ6PEY2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBA3EQ6PEY2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBA3EQ6PEY2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBA3EQ6PEY2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBA3EQ6PEY2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBA3EQ6PEY2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBA3EQ6PEY2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBA3EQ6PEY2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBA3EQ6PEY2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBA3EQ6PEY2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBA3EQ6PEY2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBA3EQ6PEY2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBA3EQ6PEY2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBA3EQ6PEY2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBA3EQ6PEY2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBA3EQ6PEY2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBA3EQ6PEY2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBA3EQ6PEY2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TUBA3EQ6PEY2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TUBA3EQ6PEY2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBA3EQ6PEY2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBA3EQ6PEY2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBA3EQ6PEY2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBA3EQ6PEY2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBA3EQ6PEY2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBA3EQ6PEY2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBA3EQ6PEY2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBA3EQ6PEY2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBA3EQ6PEY2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBA3EQ6PEY2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBA3EQ6PEY2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBA3EQ6PEY2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBA3EQ6PEY2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBA3EQ6PEY2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBA3EQ6PEY2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBA3EQ6PEY2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBA3EQ6PEY2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBA3EQ6PEY2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBA3EQ6PEY2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBA3EQ6PEY2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBA3EQ6PEY2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBA3EQ6PEY2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBA3EQ6PEY2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBA3EQ6PEY2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBA3EQ6PEY2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBA3EQ6PEY2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBA3EQ6PEY2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBA3EQ6PEY2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBA3EQ6PEY2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBA3EQ6PEY2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBA3EQ6PEY2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBA3EQ6PEY2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBA3EQ6PEY2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBA3EQ6PEY2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBA3EQ6PEY2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBA3EQ6PEY2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBA3EQ6PEY2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBA3EQ6PEY2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBA3EQ6PEY2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBA3EQ6PEY2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBA3EQ6PEY2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBA3EQ6PEY2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBA3EQ6PEY2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBA3EQ6PEY2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBA3EQ6PEY2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBA3EQ6PEY2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBA3EQ6PEY2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBA3EQ6PEY2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBA3EQ6PEY2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBA3EQ6PEY2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBA3EQ6PEY2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBA3EQ6PEY2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBA3EQ6PEY2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBA3EQ6PEY2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBA3EQ6PEY2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBA3EQ6PEY2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBA3EQ6PEY2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBA3EQ6PEY2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TUBA3EQ6PEY2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TUBA3EQ6PEY2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TUBA3EQ6PEY2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBA3EQ6PEY2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBA3EQ6PEY2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBA3EQ6PEY2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBA3EQ6PEY2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBA3EQ6PEY2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms