Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F7

LRRC8B, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8BQ6P9F7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC8BQ6P9F7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC8BQ6P9F7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC8BQ6P9F7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC8BQ6P9F7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC8BQ6P9F7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC8BQ6P9F7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC8BQ6P9F7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC8BQ6P9F7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC8BQ6P9F7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC8BQ6P9F7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC8BQ6P9F7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC8BQ6P9F7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC8BQ6P9F7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC8BQ6P9F7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC8BQ6P9F7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC8BQ6P9F7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC8BQ6P9F7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC8BQ6P9F7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC8BQ6P9F7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC8BQ6P9F7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC8BQ6P9F7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC8BQ6P9F7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC8BQ6P9F7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC8BQ6P9F7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC8BQ6P9F7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC8BQ6P9F7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC8BQ6P9F7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC8BQ6P9F7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC8BQ6P9F7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC8BQ6P9F7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC8BQ6P9F7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC8BQ6P9F7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC8BQ6P9F7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC8BQ6P9F7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC8BQ6P9F7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC8BQ6P9F7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC8BQ6P9F7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC8BQ6P9F7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC8BQ6P9F7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC8BQ6P9F7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC8BQ6P9F7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC8BQ6P9F7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC8BQ6P9F7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC8BQ6P9F7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC8BQ6P9F7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC8BQ6P9F7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC8BQ6P9F7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC8BQ6P9F7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC8BQ6P9F7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC8BQ6P9F7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC8BQ6P9F7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC8BQ6P9F7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC8BQ6P9F7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC8BQ6P9F7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC8BQ6P9F7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC8BQ6P9F7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC8BQ6P9F7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC8BQ6P9F7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC8BQ6P9F7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC8BQ6P9F7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC8BQ6P9F7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC8BQ6P9F7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC8BQ6P9F7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC8BQ6P9F7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC8BQ6P9F7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC8BQ6P9F7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC8BQ6P9F7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC8BQ6P9F7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC8BQ6P9F7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC8BQ6P9F7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC8BQ6P9F7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC8BQ6P9F7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC8BQ6P9F7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC8BQ6P9F7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC8BQ6P9F7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC8BQ6P9F7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC8BQ6P9F7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRRC8BQ6P9F7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC8BQ6P9F7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC8BQ6P9F7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC8BQ6P9F7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC8BQ6P9F7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC8BQ6P9F7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC8BQ6P9F7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC8BQ6P9F7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC8BQ6P9F7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC8BQ6P9F7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC8BQ6P9F7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC8BQ6P9F7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC8BQ6P9F7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC8BQ6P9F7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC8BQ6P9F7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC8BQ6P9F7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC8BQ6P9F7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC8BQ6P9F7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC8BQ6P9F7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC8BQ6P9F7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC8BQ6P9F7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC8BQ6P9F7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms