Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF549Q6P9A3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF549Q6P9A3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF549Q6P9A3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF549Q6P9A3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF549Q6P9A3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF549Q6P9A3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF549Q6P9A3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF549Q6P9A3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF549Q6P9A3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF549Q6P9A3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF549Q6P9A3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF549Q6P9A3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF549Q6P9A3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF549Q6P9A3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF549Q6P9A3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF549Q6P9A3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF549Q6P9A3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF549Q6P9A3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF549Q6P9A3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF549Q6P9A3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF549Q6P9A3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF549Q6P9A3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF549Q6P9A3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF549Q6P9A3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF549Q6P9A3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF549Q6P9A3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF549Q6P9A3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF549Q6P9A3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF549Q6P9A3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF549Q6P9A3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF549Q6P9A3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF549Q6P9A3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF549Q6P9A3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF549Q6P9A3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF549Q6P9A3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF549Q6P9A3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF549Q6P9A3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF549Q6P9A3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF549Q6P9A3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF549Q6P9A3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF549Q6P9A3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF549Q6P9A3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF549Q6P9A3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF549Q6P9A3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF549Q6P9A3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF549Q6P9A3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF549Q6P9A3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF549Q6P9A3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF549Q6P9A3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF549Q6P9A3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF549Q6P9A3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF549Q6P9A3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ZNF549Q6P9A3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF549Q6P9A3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF549Q6P9A3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF549Q6P9A3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF549Q6P9A3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF549Q6P9A3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF549Q6P9A3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF549Q6P9A3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF549Q6P9A3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF549Q6P9A3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF549Q6P9A3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF549Q6P9A3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF549Q6P9A3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF549Q6P9A3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF549Q6P9A3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF549Q6P9A3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF549Q6P9A3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF549Q6P9A3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF549Q6P9A3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF549Q6P9A3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF549Q6P9A3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF549Q6P9A3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF549Q6P9A3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF549Q6P9A3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF549Q6P9A3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF549Q6P9A3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF549Q6P9A3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF549Q6P9A3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF549Q6P9A3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF549Q6P9A3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF549Q6P9A3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF549Q6P9A3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF549Q6P9A3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF549Q6P9A3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF549Q6P9A3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF549Q6P9A3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF549Q6P9A3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF549Q6P9A3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF549Q6P9A3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF549Q6P9A3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF549Q6P9A3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF549Q6P9A3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF549Q6P9A3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF549Q6P9A3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF549Q6P9A3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF549Q6P9A3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF549Q6P9A3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms