Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4Q7

CNNM4, Metal transporter CNNM4, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM4Q6P4Q7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNNM4Q6P4Q7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNNM4Q6P4Q7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNNM4Q6P4Q7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNNM4Q6P4Q7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNNM4Q6P4Q7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNNM4Q6P4Q7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNNM4Q6P4Q7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNNM4Q6P4Q7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNNM4Q6P4Q7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNNM4Q6P4Q7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNNM4Q6P4Q7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNNM4Q6P4Q7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNNM4Q6P4Q7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNNM4Q6P4Q7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNNM4Q6P4Q7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNNM4Q6P4Q7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNNM4Q6P4Q7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNNM4Q6P4Q7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNNM4Q6P4Q7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNNM4Q6P4Q7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNNM4Q6P4Q7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNNM4Q6P4Q7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNNM4Q6P4Q7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNNM4Q6P4Q7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNNM4Q6P4Q7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNNM4Q6P4Q7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNNM4Q6P4Q7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNNM4Q6P4Q7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNNM4Q6P4Q7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNNM4Q6P4Q7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CNNM4Q6P4Q7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNNM4Q6P4Q7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNNM4Q6P4Q7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNNM4Q6P4Q7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNNM4Q6P4Q7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNNM4Q6P4Q7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNNM4Q6P4Q7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNNM4Q6P4Q7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNNM4Q6P4Q7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNNM4Q6P4Q7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNNM4Q6P4Q7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNNM4Q6P4Q7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNNM4Q6P4Q7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNNM4Q6P4Q7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNNM4Q6P4Q7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNNM4Q6P4Q7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNNM4Q6P4Q7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNNM4Q6P4Q7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNNM4Q6P4Q7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNNM4Q6P4Q7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CNNM4Q6P4Q7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNNM4Q6P4Q7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNNM4Q6P4Q7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNNM4Q6P4Q7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNNM4Q6P4Q7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNNM4Q6P4Q7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CNNM4Q6P4Q7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNNM4Q6P4Q7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNNM4Q6P4Q7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNNM4Q6P4Q7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNNM4Q6P4Q7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CNNM4Q6P4Q7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CNNM4Q6P4Q7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNNM4Q6P4Q7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNNM4Q6P4Q7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNNM4Q6P4Q7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNNM4Q6P4Q7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNNM4Q6P4Q7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNNM4Q6P4Q7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNNM4Q6P4Q7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.72
CNNM4Q6P4Q7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CNNM4Q6P4Q7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNNM4Q6P4Q7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNNM4Q6P4Q7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNNM4Q6P4Q7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CNNM4Q6P4Q7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNNM4Q6P4Q7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNNM4Q6P4Q7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CNNM4Q6P4Q7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNNM4Q6P4Q7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNNM4Q6P4Q7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNNM4Q6P4Q7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNNM4Q6P4Q7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNNM4Q6P4Q7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNNM4Q6P4Q7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNNM4Q6P4Q7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNNM4Q6P4Q7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNNM4Q6P4Q7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNNM4Q6P4Q7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNNM4Q6P4Q7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNNM4Q6P4Q7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNNM4Q6P4Q7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNNM4Q6P4Q7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNNM4Q6P4Q7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNNM4Q6P4Q7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNNM4Q6P4Q7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNNM4Q6P4Q7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNNM4Q6P4Q7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CNNM4Q6P4Q7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms