Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M3

LLGL2, Lethal(2) giant larvae protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LLGL2Q6P1M3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LLGL2Q6P1M3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LLGL2Q6P1M3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LLGL2Q6P1M3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LLGL2Q6P1M3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LLGL2Q6P1M3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LLGL2Q6P1M3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LLGL2Q6P1M3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LLGL2Q6P1M3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LLGL2Q6P1M3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LLGL2Q6P1M3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LLGL2Q6P1M3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LLGL2Q6P1M3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LLGL2Q6P1M3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LLGL2Q6P1M3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LLGL2Q6P1M3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LLGL2Q6P1M3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LLGL2Q6P1M3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LLGL2Q6P1M3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LLGL2Q6P1M3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LLGL2Q6P1M3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LLGL2Q6P1M3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LLGL2Q6P1M3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LLGL2Q6P1M3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LLGL2Q6P1M3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LLGL2Q6P1M3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LLGL2Q6P1M3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LLGL2Q6P1M3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LLGL2Q6P1M3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LLGL2Q6P1M3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LLGL2Q6P1M3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LLGL2Q6P1M3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LLGL2Q6P1M3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LLGL2Q6P1M3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LLGL2Q6P1M3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LLGL2Q6P1M3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LLGL2Q6P1M3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LLGL2Q6P1M3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LLGL2Q6P1M3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LLGL2Q6P1M3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LLGL2Q6P1M3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LLGL2Q6P1M3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LLGL2Q6P1M3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LLGL2Q6P1M3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LLGL2Q6P1M3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LLGL2Q6P1M3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LLGL2Q6P1M3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LLGL2Q6P1M3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LLGL2Q6P1M3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LLGL2Q6P1M3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LLGL2Q6P1M3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LLGL2Q6P1M3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LLGL2Q6P1M3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LLGL2Q6P1M3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LLGL2Q6P1M3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LLGL2Q6P1M3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LLGL2Q6P1M3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LLGL2Q6P1M3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LLGL2Q6P1M3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LLGL2Q6P1M3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LLGL2Q6P1M3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LLGL2Q6P1M3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LLGL2Q6P1M3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LLGL2Q6P1M3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LLGL2Q6P1M3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LLGL2Q6P1M3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LLGL2Q6P1M3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LLGL2Q6P1M3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LLGL2Q6P1M3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LLGL2Q6P1M3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LLGL2Q6P1M3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LLGL2Q6P1M3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LLGL2Q6P1M3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LLGL2Q6P1M3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LLGL2Q6P1M3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LLGL2Q6P1M3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LLGL2Q6P1M3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LLGL2Q6P1M3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LLGL2Q6P1M3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LLGL2Q6P1M3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LLGL2Q6P1M3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LLGL2Q6P1M3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LLGL2Q6P1M3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LLGL2Q6P1M3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LLGL2Q6P1M3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LLGL2Q6P1M3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LLGL2Q6P1M3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LLGL2Q6P1M3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LLGL2Q6P1M3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LLGL2Q6P1M3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LLGL2Q6P1M3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LLGL2Q6P1M3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LLGL2Q6P1M3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LLGL2Q6P1M3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LLGL2Q6P1M3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LLGL2Q6P1M3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LLGL2Q6P1M3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LLGL2Q6P1M3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LLGL2Q6P1M3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LLGL2Q6P1M3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms