Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW34

NEPRO, Nucleolus and neural progenitor protein, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEPROQ6NW34 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEPROQ6NW34 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEPROQ6NW34 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEPROQ6NW34 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEPROQ6NW34 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEPROQ6NW34 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEPROQ6NW34 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEPROQ6NW34 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEPROQ6NW34 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEPROQ6NW34 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEPROQ6NW34 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEPROQ6NW34 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEPROQ6NW34 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEPROQ6NW34 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NEPROQ6NW34 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEPROQ6NW34 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEPROQ6NW34 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEPROQ6NW34 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEPROQ6NW34 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEPROQ6NW34 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEPROQ6NW34 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEPROQ6NW34 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEPROQ6NW34 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEPROQ6NW34 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NEPROQ6NW34 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEPROQ6NW34 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEPROQ6NW34 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEPROQ6NW34 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEPROQ6NW34 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEPROQ6NW34 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NEPROQ6NW34 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NEPROQ6NW34 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEPROQ6NW34 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEPROQ6NW34 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEPROQ6NW34 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEPROQ6NW34 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEPROQ6NW34 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEPROQ6NW34 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEPROQ6NW34 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEPROQ6NW34 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEPROQ6NW34 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEPROQ6NW34 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEPROQ6NW34 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEPROQ6NW34 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEPROQ6NW34 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEPROQ6NW34 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEPROQ6NW34 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEPROQ6NW34 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEPROQ6NW34 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEPROQ6NW34 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEPROQ6NW34 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEPROQ6NW34 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEPROQ6NW34 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
NEPROQ6NW34 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEPROQ6NW34 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEPROQ6NW34 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEPROQ6NW34 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms