Protein–RNA interactions for Protein: Q6ISB3

GRHL2, Grainyhead-like protein 2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRHL2Q6ISB3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRHL2Q6ISB3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRHL2Q6ISB3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRHL2Q6ISB3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRHL2Q6ISB3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRHL2Q6ISB3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRHL2Q6ISB3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRHL2Q6ISB3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRHL2Q6ISB3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRHL2Q6ISB3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRHL2Q6ISB3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRHL2Q6ISB3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRHL2Q6ISB3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRHL2Q6ISB3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRHL2Q6ISB3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRHL2Q6ISB3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRHL2Q6ISB3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRHL2Q6ISB3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GRHL2Q6ISB3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GRHL2Q6ISB3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRHL2Q6ISB3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRHL2Q6ISB3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRHL2Q6ISB3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRHL2Q6ISB3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRHL2Q6ISB3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRHL2Q6ISB3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRHL2Q6ISB3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRHL2Q6ISB3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRHL2Q6ISB3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRHL2Q6ISB3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRHL2Q6ISB3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRHL2Q6ISB3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRHL2Q6ISB3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRHL2Q6ISB3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRHL2Q6ISB3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRHL2Q6ISB3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRHL2Q6ISB3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRHL2Q6ISB3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GRHL2Q6ISB3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRHL2Q6ISB3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRHL2Q6ISB3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRHL2Q6ISB3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRHL2Q6ISB3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRHL2Q6ISB3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GRHL2Q6ISB3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRHL2Q6ISB3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRHL2Q6ISB3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRHL2Q6ISB3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRHL2Q6ISB3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRHL2Q6ISB3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRHL2Q6ISB3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRHL2Q6ISB3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRHL2Q6ISB3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRHL2Q6ISB3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRHL2Q6ISB3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRHL2Q6ISB3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRHL2Q6ISB3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRHL2Q6ISB3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRHL2Q6ISB3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRHL2Q6ISB3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRHL2Q6ISB3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRHL2Q6ISB3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRHL2Q6ISB3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRHL2Q6ISB3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRHL2Q6ISB3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRHL2Q6ISB3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRHL2Q6ISB3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRHL2Q6ISB3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRHL2Q6ISB3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRHL2Q6ISB3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRHL2Q6ISB3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRHL2Q6ISB3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRHL2Q6ISB3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRHL2Q6ISB3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRHL2Q6ISB3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRHL2Q6ISB3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRHL2Q6ISB3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRHL2Q6ISB3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRHL2Q6ISB3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRHL2Q6ISB3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRHL2Q6ISB3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRHL2Q6ISB3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRHL2Q6ISB3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRHL2Q6ISB3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRHL2Q6ISB3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRHL2Q6ISB3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRHL2Q6ISB3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GRHL2Q6ISB3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GRHL2Q6ISB3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRHL2Q6ISB3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRHL2Q6ISB3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRHL2Q6ISB3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRHL2Q6ISB3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRHL2Q6ISB3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRHL2Q6ISB3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRHL2Q6ISB3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRHL2Q6ISB3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRHL2Q6ISB3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GRHL2Q6ISB3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRHL2Q6ISB3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms