Protein–RNA interactions for Protein: Q6H8Q1

ABLIM2, Actin-binding LIM protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABLIM2Q6H8Q1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ABLIM2Q6H8Q1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ABLIM2Q6H8Q1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ABLIM2Q6H8Q1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ABLIM2Q6H8Q1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ABLIM2Q6H8Q1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ABLIM2Q6H8Q1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ABLIM2Q6H8Q1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ABLIM2Q6H8Q1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ABLIM2Q6H8Q1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ABLIM2Q6H8Q1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ABLIM2Q6H8Q1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ABLIM2Q6H8Q1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ABLIM2Q6H8Q1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ABLIM2Q6H8Q1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ABLIM2Q6H8Q1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ABLIM2Q6H8Q1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ABLIM2Q6H8Q1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ABLIM2Q6H8Q1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ABLIM2Q6H8Q1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ABLIM2Q6H8Q1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ABLIM2Q6H8Q1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ABLIM2Q6H8Q1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ABLIM2Q6H8Q1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ABLIM2Q6H8Q1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ABLIM2Q6H8Q1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ABLIM2Q6H8Q1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ABLIM2Q6H8Q1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ABLIM2Q6H8Q1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ABLIM2Q6H8Q1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ABLIM2Q6H8Q1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ABLIM2Q6H8Q1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ABLIM2Q6H8Q1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ABLIM2Q6H8Q1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ABLIM2Q6H8Q1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ABLIM2Q6H8Q1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ABLIM2Q6H8Q1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ABLIM2Q6H8Q1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ABLIM2Q6H8Q1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ABLIM2Q6H8Q1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ABLIM2Q6H8Q1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ABLIM2Q6H8Q1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ABLIM2Q6H8Q1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ABLIM2Q6H8Q1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ABLIM2Q6H8Q1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ABLIM2Q6H8Q1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ABLIM2Q6H8Q1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ABLIM2Q6H8Q1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ABLIM2Q6H8Q1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ABLIM2Q6H8Q1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ABLIM2Q6H8Q1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ABLIM2Q6H8Q1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ABLIM2Q6H8Q1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ABLIM2Q6H8Q1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABLIM2Q6H8Q1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABLIM2Q6H8Q1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABLIM2Q6H8Q1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABLIM2Q6H8Q1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABLIM2Q6H8Q1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABLIM2Q6H8Q1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABLIM2Q6H8Q1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABLIM2Q6H8Q1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABLIM2Q6H8Q1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABLIM2Q6H8Q1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABLIM2Q6H8Q1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABLIM2Q6H8Q1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABLIM2Q6H8Q1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABLIM2Q6H8Q1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ABLIM2Q6H8Q1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ABLIM2Q6H8Q1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ABLIM2Q6H8Q1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ABLIM2Q6H8Q1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ABLIM2Q6H8Q1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ABLIM2Q6H8Q1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ABLIM2Q6H8Q1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABLIM2Q6H8Q1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABLIM2Q6H8Q1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABLIM2Q6H8Q1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABLIM2Q6H8Q1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABLIM2Q6H8Q1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABLIM2Q6H8Q1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ABLIM2Q6H8Q1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABLIM2Q6H8Q1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ABLIM2Q6H8Q1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABLIM2Q6H8Q1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABLIM2Q6H8Q1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABLIM2Q6H8Q1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ABLIM2Q6H8Q1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABLIM2Q6H8Q1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABLIM2Q6H8Q1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABLIM2Q6H8Q1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ABLIM2Q6H8Q1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABLIM2Q6H8Q1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABLIM2Q6H8Q1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABLIM2Q6H8Q1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABLIM2Q6H8Q1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABLIM2Q6H8Q1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABLIM2Q6H8Q1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABLIM2Q6H8Q1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ABLIM2Q6H8Q1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms