Protein–RNA interactions for Protein: Q68DU8

KCTD16, BTB/POZ domain-containing protein KCTD16, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD16Q68DU8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCTD16Q68DU8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCTD16Q68DU8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCTD16Q68DU8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCTD16Q68DU8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCTD16Q68DU8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCTD16Q68DU8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCTD16Q68DU8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCTD16Q68DU8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCTD16Q68DU8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCTD16Q68DU8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCTD16Q68DU8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCTD16Q68DU8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCTD16Q68DU8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCTD16Q68DU8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCTD16Q68DU8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCTD16Q68DU8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCTD16Q68DU8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCTD16Q68DU8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KCTD16Q68DU8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KCTD16Q68DU8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCTD16Q68DU8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCTD16Q68DU8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCTD16Q68DU8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCTD16Q68DU8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCTD16Q68DU8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCTD16Q68DU8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCTD16Q68DU8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCTD16Q68DU8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCTD16Q68DU8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCTD16Q68DU8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCTD16Q68DU8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KCTD16Q68DU8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCTD16Q68DU8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCTD16Q68DU8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCTD16Q68DU8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCTD16Q68DU8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCTD16Q68DU8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCTD16Q68DU8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCTD16Q68DU8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCTD16Q68DU8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCTD16Q68DU8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCTD16Q68DU8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCTD16Q68DU8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCTD16Q68DU8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCTD16Q68DU8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCTD16Q68DU8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCTD16Q68DU8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCTD16Q68DU8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCTD16Q68DU8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCTD16Q68DU8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCTD16Q68DU8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCTD16Q68DU8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCTD16Q68DU8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCTD16Q68DU8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCTD16Q68DU8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCTD16Q68DU8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCTD16Q68DU8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KCTD16Q68DU8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCTD16Q68DU8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCTD16Q68DU8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCTD16Q68DU8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCTD16Q68DU8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCTD16Q68DU8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCTD16Q68DU8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCTD16Q68DU8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCTD16Q68DU8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCTD16Q68DU8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KCTD16Q68DU8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KCTD16Q68DU8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KCTD16Q68DU8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCTD16Q68DU8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCTD16Q68DU8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCTD16Q68DU8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCTD16Q68DU8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCTD16Q68DU8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCTD16Q68DU8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCTD16Q68DU8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCTD16Q68DU8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCTD16Q68DU8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCTD16Q68DU8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCTD16Q68DU8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCTD16Q68DU8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCTD16Q68DU8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCTD16Q68DU8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCTD16Q68DU8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCTD16Q68DU8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCTD16Q68DU8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCTD16Q68DU8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCTD16Q68DU8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCTD16Q68DU8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCTD16Q68DU8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KCTD16Q68DU8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCTD16Q68DU8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCTD16Q68DU8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCTD16Q68DU8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCTD16Q68DU8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCTD16Q68DU8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCTD16Q68DU8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCTD16Q68DU8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms