Protein–RNA interactions for Protein: Q66K89

E4F1, Transcription factor E4F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4F1Q66K89 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
E4F1Q66K89 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
E4F1Q66K89 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
E4F1Q66K89 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
E4F1Q66K89 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
E4F1Q66K89 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
E4F1Q66K89 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
E4F1Q66K89 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
E4F1Q66K89 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
E4F1Q66K89 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
E4F1Q66K89 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
E4F1Q66K89 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
E4F1Q66K89 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
E4F1Q66K89 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
E4F1Q66K89 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
E4F1Q66K89 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
E4F1Q66K89 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
E4F1Q66K89 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
E4F1Q66K89 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
E4F1Q66K89 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
E4F1Q66K89 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
E4F1Q66K89 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
E4F1Q66K89 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
E4F1Q66K89 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
E4F1Q66K89 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
E4F1Q66K89 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
E4F1Q66K89 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
E4F1Q66K89 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
E4F1Q66K89 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
E4F1Q66K89 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
E4F1Q66K89 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
E4F1Q66K89 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
E4F1Q66K89 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
E4F1Q66K89 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
E4F1Q66K89 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
E4F1Q66K89 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
E4F1Q66K89 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
E4F1Q66K89 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
E4F1Q66K89 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
E4F1Q66K89 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
E4F1Q66K89 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
E4F1Q66K89 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
E4F1Q66K89 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
E4F1Q66K89 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
E4F1Q66K89 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
E4F1Q66K89 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
E4F1Q66K89 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
E4F1Q66K89 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
E4F1Q66K89 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
E4F1Q66K89 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
E4F1Q66K89 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
E4F1Q66K89 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
E4F1Q66K89 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
E4F1Q66K89 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
E4F1Q66K89 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
E4F1Q66K89 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
E4F1Q66K89 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
E4F1Q66K89 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
E4F1Q66K89 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
E4F1Q66K89 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
E4F1Q66K89 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
E4F1Q66K89 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
E4F1Q66K89 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
E4F1Q66K89 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
E4F1Q66K89 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
E4F1Q66K89 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
E4F1Q66K89 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
E4F1Q66K89 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
E4F1Q66K89 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
E4F1Q66K89 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
E4F1Q66K89 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
E4F1Q66K89 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
E4F1Q66K89 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
E4F1Q66K89 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
E4F1Q66K89 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
E4F1Q66K89 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
E4F1Q66K89 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
E4F1Q66K89 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
E4F1Q66K89 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
E4F1Q66K89 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
E4F1Q66K89 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
E4F1Q66K89 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
E4F1Q66K89 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
E4F1Q66K89 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
E4F1Q66K89 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
E4F1Q66K89 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
E4F1Q66K89 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
E4F1Q66K89 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
E4F1Q66K89 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
E4F1Q66K89 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
E4F1Q66K89 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
E4F1Q66K89 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
E4F1Q66K89 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
E4F1Q66K89 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
E4F1Q66K89 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
E4F1Q66K89 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
E4F1Q66K89 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
E4F1Q66K89 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
E4F1Q66K89 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
E4F1Q66K89 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms