Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ89

DENND4C, DENN domain-containing protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND4CQ5VZ89 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DENND4CQ5VZ89 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DENND4CQ5VZ89 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DENND4CQ5VZ89 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DENND4CQ5VZ89 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DENND4CQ5VZ89 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
DENND4CQ5VZ89 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DENND4CQ5VZ89 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DENND4CQ5VZ89 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DENND4CQ5VZ89 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DENND4CQ5VZ89 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DENND4CQ5VZ89 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
DENND4CQ5VZ89 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DENND4CQ5VZ89 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DENND4CQ5VZ89 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DENND4CQ5VZ89 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DENND4CQ5VZ89 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DENND4CQ5VZ89 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DENND4CQ5VZ89 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DENND4CQ5VZ89 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DENND4CQ5VZ89 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND4CQ5VZ89 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND4CQ5VZ89 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND4CQ5VZ89 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND4CQ5VZ89 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND4CQ5VZ89 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND4CQ5VZ89 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND4CQ5VZ89 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND4CQ5VZ89 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND4CQ5VZ89 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DENND4CQ5VZ89 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DENND4CQ5VZ89 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DENND4CQ5VZ89 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DENND4CQ5VZ89 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DENND4CQ5VZ89 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DENND4CQ5VZ89 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DENND4CQ5VZ89 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DENND4CQ5VZ89 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DENND4CQ5VZ89 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DENND4CQ5VZ89 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DENND4CQ5VZ89 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DENND4CQ5VZ89 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND4CQ5VZ89 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND4CQ5VZ89 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND4CQ5VZ89 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND4CQ5VZ89 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND4CQ5VZ89 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DENND4CQ5VZ89 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
DENND4CQ5VZ89 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DENND4CQ5VZ89 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
DENND4CQ5VZ89 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DENND4CQ5VZ89 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DENND4CQ5VZ89 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DENND4CQ5VZ89 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DENND4CQ5VZ89 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DENND4CQ5VZ89 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DENND4CQ5VZ89 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DENND4CQ5VZ89 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DENND4CQ5VZ89 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DENND4CQ5VZ89 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DENND4CQ5VZ89 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DENND4CQ5VZ89 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DENND4CQ5VZ89 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DENND4CQ5VZ89 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DENND4CQ5VZ89 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DENND4CQ5VZ89 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DENND4CQ5VZ89 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DENND4CQ5VZ89 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DENND4CQ5VZ89 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DENND4CQ5VZ89 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DENND4CQ5VZ89 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DENND4CQ5VZ89 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DENND4CQ5VZ89 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DENND4CQ5VZ89 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DENND4CQ5VZ89 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DENND4CQ5VZ89 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DENND4CQ5VZ89 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
DENND4CQ5VZ89 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DENND4CQ5VZ89 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DENND4CQ5VZ89 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DENND4CQ5VZ89 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DENND4CQ5VZ89 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DENND4CQ5VZ89 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DENND4CQ5VZ89 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
DENND4CQ5VZ89 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DENND4CQ5VZ89 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DENND4CQ5VZ89 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DENND4CQ5VZ89 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
DENND4CQ5VZ89 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DENND4CQ5VZ89 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DENND4CQ5VZ89 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DENND4CQ5VZ89 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DENND4CQ5VZ89 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DENND4CQ5VZ89 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DENND4CQ5VZ89 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DENND4CQ5VZ89 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DENND4CQ5VZ89 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DENND4CQ5VZ89 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DENND4CQ5VZ89 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DENND4CQ5VZ89 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms