Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTE0

EEF1A1P5, Putative elongation factor 1-alpha-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P5Q5VTE0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEF1A1P5Q5VTE0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEF1A1P5Q5VTE0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEF1A1P5Q5VTE0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEF1A1P5Q5VTE0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEF1A1P5Q5VTE0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
EEF1A1P5Q5VTE0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEF1A1P5Q5VTE0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEF1A1P5Q5VTE0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEF1A1P5Q5VTE0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEF1A1P5Q5VTE0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EEF1A1P5Q5VTE0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EEF1A1P5Q5VTE0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EEF1A1P5Q5VTE0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EEF1A1P5Q5VTE0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EEF1A1P5Q5VTE0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EEF1A1P5Q5VTE0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EEF1A1P5Q5VTE0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
EEF1A1P5Q5VTE0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
EEF1A1P5Q5VTE0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EEF1A1P5Q5VTE0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EEF1A1P5Q5VTE0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EEF1A1P5Q5VTE0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EEF1A1P5Q5VTE0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EEF1A1P5Q5VTE0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EEF1A1P5Q5VTE0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EEF1A1P5Q5VTE0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EEF1A1P5Q5VTE0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EEF1A1P5Q5VTE0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EEF1A1P5Q5VTE0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EEF1A1P5Q5VTE0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EEF1A1P5Q5VTE0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EEF1A1P5Q5VTE0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EEF1A1P5Q5VTE0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EEF1A1P5Q5VTE0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EEF1A1P5Q5VTE0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
EEF1A1P5Q5VTE0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EEF1A1P5Q5VTE0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EEF1A1P5Q5VTE0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EEF1A1P5Q5VTE0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EEF1A1P5Q5VTE0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EEF1A1P5Q5VTE0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EEF1A1P5Q5VTE0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EEF1A1P5Q5VTE0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EEF1A1P5Q5VTE0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EEF1A1P5Q5VTE0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EEF1A1P5Q5VTE0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EEF1A1P5Q5VTE0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EEF1A1P5Q5VTE0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EEF1A1P5Q5VTE0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EEF1A1P5Q5VTE0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EEF1A1P5Q5VTE0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
EEF1A1P5Q5VTE0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
EEF1A1P5Q5VTE0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
EEF1A1P5Q5VTE0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EEF1A1P5Q5VTE0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EEF1A1P5Q5VTE0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EEF1A1P5Q5VTE0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EEF1A1P5Q5VTE0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EEF1A1P5Q5VTE0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EEF1A1P5Q5VTE0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
EEF1A1P5Q5VTE0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EEF1A1P5Q5VTE0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EEF1A1P5Q5VTE0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EEF1A1P5Q5VTE0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EEF1A1P5Q5VTE0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EEF1A1P5Q5VTE0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EEF1A1P5Q5VTE0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EEF1A1P5Q5VTE0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EEF1A1P5Q5VTE0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EEF1A1P5Q5VTE0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EEF1A1P5Q5VTE0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EEF1A1P5Q5VTE0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EEF1A1P5Q5VTE0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EEF1A1P5Q5VTE0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EEF1A1P5Q5VTE0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EEF1A1P5Q5VTE0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
EEF1A1P5Q5VTE0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EEF1A1P5Q5VTE0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EEF1A1P5Q5VTE0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EEF1A1P5Q5VTE0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EEF1A1P5Q5VTE0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EEF1A1P5Q5VTE0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EEF1A1P5Q5VTE0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EEF1A1P5Q5VTE0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EEF1A1P5Q5VTE0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EEF1A1P5Q5VTE0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EEF1A1P5Q5VTE0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EEF1A1P5Q5VTE0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
EEF1A1P5Q5VTE0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms