Protein–RNA interactions for Protein: Q5TKA1

LIN9, Protein lin-9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN9Q5TKA1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LIN9Q5TKA1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LIN9Q5TKA1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LIN9Q5TKA1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LIN9Q5TKA1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LIN9Q5TKA1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LIN9Q5TKA1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LIN9Q5TKA1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LIN9Q5TKA1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LIN9Q5TKA1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LIN9Q5TKA1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LIN9Q5TKA1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LIN9Q5TKA1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LIN9Q5TKA1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LIN9Q5TKA1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LIN9Q5TKA1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LIN9Q5TKA1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LIN9Q5TKA1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LIN9Q5TKA1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LIN9Q5TKA1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LIN9Q5TKA1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LIN9Q5TKA1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LIN9Q5TKA1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LIN9Q5TKA1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LIN9Q5TKA1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LIN9Q5TKA1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LIN9Q5TKA1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LIN9Q5TKA1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LIN9Q5TKA1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LIN9Q5TKA1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LIN9Q5TKA1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LIN9Q5TKA1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LIN9Q5TKA1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LIN9Q5TKA1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LIN9Q5TKA1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LIN9Q5TKA1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LIN9Q5TKA1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LIN9Q5TKA1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LIN9Q5TKA1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LIN9Q5TKA1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LIN9Q5TKA1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LIN9Q5TKA1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LIN9Q5TKA1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LIN9Q5TKA1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LIN9Q5TKA1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LIN9Q5TKA1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LIN9Q5TKA1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LIN9Q5TKA1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LIN9Q5TKA1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LIN9Q5TKA1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LIN9Q5TKA1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LIN9Q5TKA1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LIN9Q5TKA1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LIN9Q5TKA1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LIN9Q5TKA1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LIN9Q5TKA1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LIN9Q5TKA1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LIN9Q5TKA1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LIN9Q5TKA1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LIN9Q5TKA1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LIN9Q5TKA1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LIN9Q5TKA1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LIN9Q5TKA1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LIN9Q5TKA1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LIN9Q5TKA1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LIN9Q5TKA1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LIN9Q5TKA1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LIN9Q5TKA1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LIN9Q5TKA1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LIN9Q5TKA1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LIN9Q5TKA1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LIN9Q5TKA1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LIN9Q5TKA1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LIN9Q5TKA1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LIN9Q5TKA1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LIN9Q5TKA1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LIN9Q5TKA1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LIN9Q5TKA1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LIN9Q5TKA1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LIN9Q5TKA1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LIN9Q5TKA1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LIN9Q5TKA1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LIN9Q5TKA1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LIN9Q5TKA1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LIN9Q5TKA1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LIN9Q5TKA1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LIN9Q5TKA1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LIN9Q5TKA1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LIN9Q5TKA1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LIN9Q5TKA1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LIN9Q5TKA1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LIN9Q5TKA1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LIN9Q5TKA1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LIN9Q5TKA1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LIN9Q5TKA1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LIN9Q5TKA1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LIN9Q5TKA1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LIN9Q5TKA1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LIN9Q5TKA1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LIN9Q5TKA1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms