Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQQ9

VAX1, Ventral anterior homeobox 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX1Q5SQQ9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
VAX1Q5SQQ9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
VAX1Q5SQQ9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
VAX1Q5SQQ9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
VAX1Q5SQQ9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
VAX1Q5SQQ9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
VAX1Q5SQQ9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
VAX1Q5SQQ9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
VAX1Q5SQQ9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
VAX1Q5SQQ9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
VAX1Q5SQQ9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
VAX1Q5SQQ9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VAX1Q5SQQ9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VAX1Q5SQQ9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
VAX1Q5SQQ9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
VAX1Q5SQQ9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
VAX1Q5SQQ9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VAX1Q5SQQ9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VAX1Q5SQQ9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VAX1Q5SQQ9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VAX1Q5SQQ9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VAX1Q5SQQ9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
VAX1Q5SQQ9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
VAX1Q5SQQ9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VAX1Q5SQQ9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VAX1Q5SQQ9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
VAX1Q5SQQ9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
VAX1Q5SQQ9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms