Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRMS1LQ5PSV4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRMS1LQ5PSV4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRMS1LQ5PSV4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
BRMS1LQ5PSV4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRMS1LQ5PSV4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRMS1LQ5PSV4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRMS1LQ5PSV4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRMS1LQ5PSV4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRMS1LQ5PSV4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRMS1LQ5PSV4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRMS1LQ5PSV4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRMS1LQ5PSV4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRMS1LQ5PSV4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
BRMS1LQ5PSV4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRMS1LQ5PSV4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRMS1LQ5PSV4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRMS1LQ5PSV4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRMS1LQ5PSV4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRMS1LQ5PSV4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRMS1LQ5PSV4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRMS1LQ5PSV4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRMS1LQ5PSV4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRMS1LQ5PSV4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRMS1LQ5PSV4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRMS1LQ5PSV4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRMS1LQ5PSV4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRMS1LQ5PSV4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRMS1LQ5PSV4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRMS1LQ5PSV4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRMS1LQ5PSV4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
BRMS1LQ5PSV4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRMS1LQ5PSV4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRMS1LQ5PSV4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRMS1LQ5PSV4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRMS1LQ5PSV4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRMS1LQ5PSV4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRMS1LQ5PSV4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRMS1LQ5PSV4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRMS1LQ5PSV4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRMS1LQ5PSV4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRMS1LQ5PSV4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRMS1LQ5PSV4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRMS1LQ5PSV4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRMS1LQ5PSV4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRMS1LQ5PSV4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRMS1LQ5PSV4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRMS1LQ5PSV4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRMS1LQ5PSV4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRMS1LQ5PSV4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRMS1LQ5PSV4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
BRMS1LQ5PSV4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRMS1LQ5PSV4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRMS1LQ5PSV4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRMS1LQ5PSV4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRMS1LQ5PSV4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRMS1LQ5PSV4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
BRMS1LQ5PSV4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRMS1LQ5PSV4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRMS1LQ5PSV4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRMS1LQ5PSV4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
BRMS1LQ5PSV4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRMS1LQ5PSV4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRMS1LQ5PSV4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BRMS1LQ5PSV4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRMS1LQ5PSV4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
BRMS1LQ5PSV4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRMS1LQ5PSV4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRMS1LQ5PSV4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRMS1LQ5PSV4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRMS1LQ5PSV4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRMS1LQ5PSV4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRMS1LQ5PSV4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRMS1LQ5PSV4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRMS1LQ5PSV4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRMS1LQ5PSV4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRMS1LQ5PSV4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRMS1LQ5PSV4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRMS1LQ5PSV4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
BRMS1LQ5PSV4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRMS1LQ5PSV4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRMS1LQ5PSV4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRMS1LQ5PSV4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRMS1LQ5PSV4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRMS1LQ5PSV4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRMS1LQ5PSV4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRMS1LQ5PSV4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRMS1LQ5PSV4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRMS1LQ5PSV4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRMS1LQ5PSV4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
BRMS1LQ5PSV4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRMS1LQ5PSV4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRMS1LQ5PSV4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRMS1LQ5PSV4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRMS1LQ5PSV4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRMS1LQ5PSV4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRMS1LQ5PSV4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRMS1LQ5PSV4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRMS1LQ5PSV4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRMS1LQ5PSV4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms