Protein–RNA interactions for Protein: Q5MAI5

CDKL4, Cyclin-dependent kinase-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL4Q5MAI5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKL4Q5MAI5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKL4Q5MAI5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKL4Q5MAI5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKL4Q5MAI5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKL4Q5MAI5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKL4Q5MAI5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKL4Q5MAI5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKL4Q5MAI5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKL4Q5MAI5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKL4Q5MAI5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKL4Q5MAI5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKL4Q5MAI5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKL4Q5MAI5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKL4Q5MAI5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKL4Q5MAI5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKL4Q5MAI5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKL4Q5MAI5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKL4Q5MAI5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKL4Q5MAI5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKL4Q5MAI5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKL4Q5MAI5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKL4Q5MAI5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKL4Q5MAI5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKL4Q5MAI5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKL4Q5MAI5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKL4Q5MAI5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKL4Q5MAI5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKL4Q5MAI5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKL4Q5MAI5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKL4Q5MAI5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKL4Q5MAI5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKL4Q5MAI5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKL4Q5MAI5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKL4Q5MAI5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKL4Q5MAI5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKL4Q5MAI5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKL4Q5MAI5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKL4Q5MAI5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKL4Q5MAI5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKL4Q5MAI5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKL4Q5MAI5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKL4Q5MAI5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKL4Q5MAI5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKL4Q5MAI5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKL4Q5MAI5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKL4Q5MAI5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKL4Q5MAI5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKL4Q5MAI5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKL4Q5MAI5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKL4Q5MAI5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKL4Q5MAI5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKL4Q5MAI5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKL4Q5MAI5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKL4Q5MAI5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKL4Q5MAI5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKL4Q5MAI5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKL4Q5MAI5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKL4Q5MAI5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKL4Q5MAI5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKL4Q5MAI5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKL4Q5MAI5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKL4Q5MAI5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKL4Q5MAI5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKL4Q5MAI5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKL4Q5MAI5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKL4Q5MAI5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKL4Q5MAI5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKL4Q5MAI5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKL4Q5MAI5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKL4Q5MAI5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKL4Q5MAI5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKL4Q5MAI5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKL4Q5MAI5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKL4Q5MAI5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKL4Q5MAI5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKL4Q5MAI5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKL4Q5MAI5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL4Q5MAI5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL4Q5MAI5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL4Q5MAI5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL4Q5MAI5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL4Q5MAI5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL4Q5MAI5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL4Q5MAI5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDKL4Q5MAI5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKL4Q5MAI5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKL4Q5MAI5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKL4Q5MAI5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKL4Q5MAI5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKL4Q5MAI5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKL4Q5MAI5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKL4Q5MAI5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKL4Q5MAI5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKL4Q5MAI5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKL4Q5MAI5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKL4Q5MAI5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKL4Q5MAI5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKL4Q5MAI5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKL4Q5MAI5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms