Protein–RNA interactions for Protein: Q5IJ48

CRB2, Protein crumbs homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB2Q5IJ48 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRB2Q5IJ48 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CRB2Q5IJ48 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CRB2Q5IJ48 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRB2Q5IJ48 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRB2Q5IJ48 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRB2Q5IJ48 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRB2Q5IJ48 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRB2Q5IJ48 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRB2Q5IJ48 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRB2Q5IJ48 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRB2Q5IJ48 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRB2Q5IJ48 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRB2Q5IJ48 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRB2Q5IJ48 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRB2Q5IJ48 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRB2Q5IJ48 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRB2Q5IJ48 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRB2Q5IJ48 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRB2Q5IJ48 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRB2Q5IJ48 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRB2Q5IJ48 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CRB2Q5IJ48 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRB2Q5IJ48 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRB2Q5IJ48 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRB2Q5IJ48 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRB2Q5IJ48 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRB2Q5IJ48 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CRB2Q5IJ48 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRB2Q5IJ48 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRB2Q5IJ48 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRB2Q5IJ48 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRB2Q5IJ48 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRB2Q5IJ48 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRB2Q5IJ48 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRB2Q5IJ48 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRB2Q5IJ48 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRB2Q5IJ48 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRB2Q5IJ48 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRB2Q5IJ48 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRB2Q5IJ48 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRB2Q5IJ48 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRB2Q5IJ48 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CRB2Q5IJ48 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRB2Q5IJ48 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRB2Q5IJ48 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CRB2Q5IJ48 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CRB2Q5IJ48 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CRB2Q5IJ48 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CRB2Q5IJ48 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRB2Q5IJ48 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRB2Q5IJ48 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRB2Q5IJ48 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRB2Q5IJ48 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRB2Q5IJ48 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRB2Q5IJ48 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRB2Q5IJ48 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRB2Q5IJ48 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRB2Q5IJ48 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRB2Q5IJ48 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRB2Q5IJ48 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRB2Q5IJ48 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRB2Q5IJ48 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRB2Q5IJ48 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRB2Q5IJ48 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRB2Q5IJ48 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRB2Q5IJ48 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRB2Q5IJ48 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRB2Q5IJ48 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRB2Q5IJ48 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRB2Q5IJ48 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRB2Q5IJ48 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRB2Q5IJ48 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRB2Q5IJ48 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRB2Q5IJ48 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRB2Q5IJ48 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRB2Q5IJ48 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRB2Q5IJ48 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRB2Q5IJ48 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRB2Q5IJ48 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRB2Q5IJ48 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRB2Q5IJ48 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRB2Q5IJ48 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRB2Q5IJ48 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRB2Q5IJ48 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRB2Q5IJ48 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRB2Q5IJ48 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRB2Q5IJ48 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRB2Q5IJ48 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CRB2Q5IJ48 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRB2Q5IJ48 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CRB2Q5IJ48 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRB2Q5IJ48 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CRB2Q5IJ48 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRB2Q5IJ48 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRB2Q5IJ48 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRB2Q5IJ48 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRB2Q5IJ48 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRB2Q5IJ48 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRB2Q5IJ48 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms