Protein–RNA interactions for Protein: Q53GS7

GLE1, Nucleoporin GLE1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLE1Q53GS7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GLE1Q53GS7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GLE1Q53GS7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GLE1Q53GS7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GLE1Q53GS7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GLE1Q53GS7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GLE1Q53GS7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GLE1Q53GS7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GLE1Q53GS7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GLE1Q53GS7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GLE1Q53GS7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GLE1Q53GS7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GLE1Q53GS7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GLE1Q53GS7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GLE1Q53GS7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GLE1Q53GS7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GLE1Q53GS7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GLE1Q53GS7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GLE1Q53GS7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GLE1Q53GS7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GLE1Q53GS7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GLE1Q53GS7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GLE1Q53GS7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GLE1Q53GS7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GLE1Q53GS7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GLE1Q53GS7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GLE1Q53GS7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GLE1Q53GS7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GLE1Q53GS7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GLE1Q53GS7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GLE1Q53GS7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GLE1Q53GS7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GLE1Q53GS7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GLE1Q53GS7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GLE1Q53GS7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GLE1Q53GS7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GLE1Q53GS7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GLE1Q53GS7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GLE1Q53GS7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GLE1Q53GS7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GLE1Q53GS7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GLE1Q53GS7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GLE1Q53GS7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GLE1Q53GS7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GLE1Q53GS7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GLE1Q53GS7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GLE1Q53GS7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GLE1Q53GS7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GLE1Q53GS7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GLE1Q53GS7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GLE1Q53GS7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GLE1Q53GS7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GLE1Q53GS7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GLE1Q53GS7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GLE1Q53GS7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GLE1Q53GS7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GLE1Q53GS7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GLE1Q53GS7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GLE1Q53GS7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GLE1Q53GS7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GLE1Q53GS7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GLE1Q53GS7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GLE1Q53GS7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GLE1Q53GS7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GLE1Q53GS7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GLE1Q53GS7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GLE1Q53GS7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GLE1Q53GS7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GLE1Q53GS7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GLE1Q53GS7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GLE1Q53GS7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GLE1Q53GS7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GLE1Q53GS7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GLE1Q53GS7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GLE1Q53GS7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GLE1Q53GS7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLE1Q53GS7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLE1Q53GS7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLE1Q53GS7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLE1Q53GS7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLE1Q53GS7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLE1Q53GS7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLE1Q53GS7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLE1Q53GS7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GLE1Q53GS7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLE1Q53GS7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GLE1Q53GS7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GLE1Q53GS7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GLE1Q53GS7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GLE1Q53GS7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GLE1Q53GS7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GLE1Q53GS7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GLE1Q53GS7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GLE1Q53GS7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GLE1Q53GS7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GLE1Q53GS7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GLE1Q53GS7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GLE1Q53GS7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GLE1Q53GS7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GLE1Q53GS7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms