Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACSM3Q53FZ2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACSM3Q53FZ2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACSM3Q53FZ2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACSM3Q53FZ2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACSM3Q53FZ2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACSM3Q53FZ2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACSM3Q53FZ2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACSM3Q53FZ2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ACSM3Q53FZ2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACSM3Q53FZ2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ACSM3Q53FZ2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACSM3Q53FZ2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACSM3Q53FZ2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACSM3Q53FZ2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACSM3Q53FZ2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACSM3Q53FZ2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACSM3Q53FZ2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACSM3Q53FZ2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACSM3Q53FZ2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACSM3Q53FZ2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACSM3Q53FZ2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ACSM3Q53FZ2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACSM3Q53FZ2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACSM3Q53FZ2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACSM3Q53FZ2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACSM3Q53FZ2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACSM3Q53FZ2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACSM3Q53FZ2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACSM3Q53FZ2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACSM3Q53FZ2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACSM3Q53FZ2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACSM3Q53FZ2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACSM3Q53FZ2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACSM3Q53FZ2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACSM3Q53FZ2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACSM3Q53FZ2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACSM3Q53FZ2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACSM3Q53FZ2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACSM3Q53FZ2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACSM3Q53FZ2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACSM3Q53FZ2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACSM3Q53FZ2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACSM3Q53FZ2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ACSM3Q53FZ2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACSM3Q53FZ2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACSM3Q53FZ2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACSM3Q53FZ2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACSM3Q53FZ2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ACSM3Q53FZ2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACSM3Q53FZ2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACSM3Q53FZ2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACSM3Q53FZ2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACSM3Q53FZ2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACSM3Q53FZ2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACSM3Q53FZ2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACSM3Q53FZ2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACSM3Q53FZ2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACSM3Q53FZ2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACSM3Q53FZ2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACSM3Q53FZ2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACSM3Q53FZ2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACSM3Q53FZ2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACSM3Q53FZ2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACSM3Q53FZ2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACSM3Q53FZ2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACSM3Q53FZ2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACSM3Q53FZ2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACSM3Q53FZ2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACSM3Q53FZ2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ACSM3Q53FZ2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACSM3Q53FZ2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACSM3Q53FZ2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACSM3Q53FZ2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACSM3Q53FZ2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACSM3Q53FZ2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACSM3Q53FZ2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACSM3Q53FZ2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACSM3Q53FZ2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACSM3Q53FZ2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACSM3Q53FZ2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACSM3Q53FZ2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACSM3Q53FZ2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACSM3Q53FZ2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACSM3Q53FZ2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACSM3Q53FZ2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACSM3Q53FZ2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACSM3Q53FZ2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACSM3Q53FZ2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACSM3Q53FZ2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACSM3Q53FZ2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACSM3Q53FZ2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACSM3Q53FZ2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACSM3Q53FZ2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACSM3Q53FZ2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACSM3Q53FZ2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACSM3Q53FZ2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACSM3Q53FZ2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACSM3Q53FZ2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ACSM3Q53FZ2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms