Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPAT3Q53EU6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPAT3Q53EU6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPAT3Q53EU6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPAT3Q53EU6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPAT3Q53EU6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPAT3Q53EU6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPAT3Q53EU6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPAT3Q53EU6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPAT3Q53EU6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPAT3Q53EU6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPAT3Q53EU6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPAT3Q53EU6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPAT3Q53EU6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPAT3Q53EU6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPAT3Q53EU6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPAT3Q53EU6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPAT3Q53EU6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPAT3Q53EU6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPAT3Q53EU6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPAT3Q53EU6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPAT3Q53EU6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPAT3Q53EU6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPAT3Q53EU6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPAT3Q53EU6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GPAT3Q53EU6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPAT3Q53EU6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPAT3Q53EU6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPAT3Q53EU6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GPAT3Q53EU6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPAT3Q53EU6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPAT3Q53EU6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPAT3Q53EU6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPAT3Q53EU6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPAT3Q53EU6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPAT3Q53EU6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPAT3Q53EU6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPAT3Q53EU6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPAT3Q53EU6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPAT3Q53EU6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPAT3Q53EU6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPAT3Q53EU6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPAT3Q53EU6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GPAT3Q53EU6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPAT3Q53EU6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GPAT3Q53EU6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPAT3Q53EU6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPAT3Q53EU6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GPAT3Q53EU6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GPAT3Q53EU6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GPAT3Q53EU6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GPAT3Q53EU6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPAT3Q53EU6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPAT3Q53EU6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPAT3Q53EU6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPAT3Q53EU6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPAT3Q53EU6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPAT3Q53EU6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPAT3Q53EU6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPAT3Q53EU6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPAT3Q53EU6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPAT3Q53EU6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPAT3Q53EU6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPAT3Q53EU6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPAT3Q53EU6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPAT3Q53EU6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPAT3Q53EU6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPAT3Q53EU6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPAT3Q53EU6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GPAT3Q53EU6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPAT3Q53EU6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPAT3Q53EU6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPAT3Q53EU6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPAT3Q53EU6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPAT3Q53EU6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPAT3Q53EU6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GPAT3Q53EU6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPAT3Q53EU6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPAT3Q53EU6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPAT3Q53EU6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPAT3Q53EU6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPAT3Q53EU6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPAT3Q53EU6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPAT3Q53EU6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPAT3Q53EU6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPAT3Q53EU6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPAT3Q53EU6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPAT3Q53EU6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPAT3Q53EU6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPAT3Q53EU6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPAT3Q53EU6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPAT3Q53EU6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPAT3Q53EU6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPAT3Q53EU6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPAT3Q53EU6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPAT3Q53EU6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPAT3Q53EU6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GPAT3Q53EU6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPAT3Q53EU6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPAT3Q53EU6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms