Protein–RNA interactions for Protein: Q52LC2

ATP6AP1L, V-type proton ATPase subunit S1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1LQ52LC2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP6AP1LQ52LC2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP6AP1LQ52LC2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP6AP1LQ52LC2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP6AP1LQ52LC2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP6AP1LQ52LC2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP6AP1LQ52LC2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP6AP1LQ52LC2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP6AP1LQ52LC2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP6AP1LQ52LC2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP6AP1LQ52LC2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP6AP1LQ52LC2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP6AP1LQ52LC2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP6AP1LQ52LC2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP6AP1LQ52LC2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP6AP1LQ52LC2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP6AP1LQ52LC2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP6AP1LQ52LC2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP6AP1LQ52LC2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP6AP1LQ52LC2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP6AP1LQ52LC2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP6AP1LQ52LC2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP6AP1LQ52LC2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP6AP1LQ52LC2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP6AP1LQ52LC2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP6AP1LQ52LC2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP6AP1LQ52LC2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP6AP1LQ52LC2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP6AP1LQ52LC2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP6AP1LQ52LC2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP6AP1LQ52LC2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP6AP1LQ52LC2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP6AP1LQ52LC2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP6AP1LQ52LC2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP6AP1LQ52LC2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP6AP1LQ52LC2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP6AP1LQ52LC2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP6AP1LQ52LC2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP6AP1LQ52LC2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP6AP1LQ52LC2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP6AP1LQ52LC2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP6AP1LQ52LC2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP6AP1LQ52LC2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP6AP1LQ52LC2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP6AP1LQ52LC2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP6AP1LQ52LC2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP6AP1LQ52LC2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP6AP1LQ52LC2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP6AP1LQ52LC2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP6AP1LQ52LC2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP6AP1LQ52LC2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP6AP1LQ52LC2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP6AP1LQ52LC2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP6AP1LQ52LC2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP6AP1LQ52LC2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP6AP1LQ52LC2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP6AP1LQ52LC2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP6AP1LQ52LC2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP6AP1LQ52LC2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP6AP1LQ52LC2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP6AP1LQ52LC2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP6AP1LQ52LC2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP6AP1LQ52LC2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP6AP1LQ52LC2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP6AP1LQ52LC2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP6AP1LQ52LC2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP6AP1LQ52LC2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP6AP1LQ52LC2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP6AP1LQ52LC2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP6AP1LQ52LC2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP6AP1LQ52LC2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP6AP1LQ52LC2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP6AP1LQ52LC2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP6AP1LQ52LC2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP6AP1LQ52LC2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP6AP1LQ52LC2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP6AP1LQ52LC2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP6AP1LQ52LC2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP6AP1LQ52LC2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP6AP1LQ52LC2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP6AP1LQ52LC2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP6AP1LQ52LC2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP6AP1LQ52LC2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP6AP1LQ52LC2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP6AP1LQ52LC2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP6AP1LQ52LC2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP6AP1LQ52LC2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP6AP1LQ52LC2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP6AP1LQ52LC2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP6AP1LQ52LC2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP6AP1LQ52LC2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP6AP1LQ52LC2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP6AP1LQ52LC2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP6AP1LQ52LC2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP6AP1LQ52LC2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP6AP1LQ52LC2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP6AP1LQ52LC2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP6AP1LQ52LC2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP6AP1LQ52LC2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP6AP1LQ52LC2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms