Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKDCCQ504Y2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKDCCQ504Y2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKDCCQ504Y2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKDCCQ504Y2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKDCCQ504Y2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKDCCQ504Y2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKDCCQ504Y2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PKDCCQ504Y2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKDCCQ504Y2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKDCCQ504Y2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKDCCQ504Y2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKDCCQ504Y2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKDCCQ504Y2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKDCCQ504Y2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKDCCQ504Y2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKDCCQ504Y2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKDCCQ504Y2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKDCCQ504Y2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKDCCQ504Y2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKDCCQ504Y2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKDCCQ504Y2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PKDCCQ504Y2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKDCCQ504Y2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKDCCQ504Y2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKDCCQ504Y2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKDCCQ504Y2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKDCCQ504Y2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKDCCQ504Y2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKDCCQ504Y2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PKDCCQ504Y2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKDCCQ504Y2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKDCCQ504Y2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKDCCQ504Y2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKDCCQ504Y2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKDCCQ504Y2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKDCCQ504Y2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKDCCQ504Y2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKDCCQ504Y2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKDCCQ504Y2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKDCCQ504Y2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKDCCQ504Y2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKDCCQ504Y2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKDCCQ504Y2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PKDCCQ504Y2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKDCCQ504Y2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKDCCQ504Y2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKDCCQ504Y2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKDCCQ504Y2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKDCCQ504Y2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKDCCQ504Y2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKDCCQ504Y2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKDCCQ504Y2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKDCCQ504Y2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKDCCQ504Y2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PKDCCQ504Y2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKDCCQ504Y2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKDCCQ504Y2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKDCCQ504Y2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKDCCQ504Y2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKDCCQ504Y2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKDCCQ504Y2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKDCCQ504Y2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKDCCQ504Y2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKDCCQ504Y2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKDCCQ504Y2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKDCCQ504Y2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PKDCCQ504Y2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PKDCCQ504Y2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PKDCCQ504Y2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKDCCQ504Y2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKDCCQ504Y2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKDCCQ504Y2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKDCCQ504Y2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKDCCQ504Y2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKDCCQ504Y2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKDCCQ504Y2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKDCCQ504Y2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKDCCQ504Y2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKDCCQ504Y2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKDCCQ504Y2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKDCCQ504Y2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKDCCQ504Y2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKDCCQ504Y2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PKDCCQ504Y2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PKDCCQ504Y2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKDCCQ504Y2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKDCCQ504Y2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKDCCQ504Y2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PKDCCQ504Y2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKDCCQ504Y2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKDCCQ504Y2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKDCCQ504Y2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKDCCQ504Y2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKDCCQ504Y2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKDCCQ504Y2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKDCCQ504Y2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKDCCQ504Y2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKDCCQ504Y2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKDCCQ504Y2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms