Protein–RNA interactions for Protein: Q504Q3

PAN2, PAN2-PAN3 deadenylation complex catalytic subunit PAN2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN2Q504Q3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAN2Q504Q3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAN2Q504Q3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAN2Q504Q3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAN2Q504Q3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAN2Q504Q3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAN2Q504Q3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAN2Q504Q3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAN2Q504Q3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAN2Q504Q3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAN2Q504Q3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAN2Q504Q3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAN2Q504Q3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAN2Q504Q3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAN2Q504Q3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PAN2Q504Q3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PAN2Q504Q3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PAN2Q504Q3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PAN2Q504Q3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PAN2Q504Q3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PAN2Q504Q3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PAN2Q504Q3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PAN2Q504Q3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PAN2Q504Q3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PAN2Q504Q3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PAN2Q504Q3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAN2Q504Q3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAN2Q504Q3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAN2Q504Q3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAN2Q504Q3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAN2Q504Q3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAN2Q504Q3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAN2Q504Q3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAN2Q504Q3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAN2Q504Q3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAN2Q504Q3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAN2Q504Q3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAN2Q504Q3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAN2Q504Q3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PAN2Q504Q3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAN2Q504Q3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PAN2Q504Q3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PAN2Q504Q3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PAN2Q504Q3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PAN2Q504Q3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PAN2Q504Q3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PAN2Q504Q3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PAN2Q504Q3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAN2Q504Q3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAN2Q504Q3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAN2Q504Q3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAN2Q504Q3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAN2Q504Q3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PAN2Q504Q3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAN2Q504Q3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAN2Q504Q3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PAN2Q504Q3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAN2Q504Q3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAN2Q504Q3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAN2Q504Q3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAN2Q504Q3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAN2Q504Q3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAN2Q504Q3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAN2Q504Q3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAN2Q504Q3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAN2Q504Q3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAN2Q504Q3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAN2Q504Q3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAN2Q504Q3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PAN2Q504Q3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PAN2Q504Q3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PAN2Q504Q3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PAN2Q504Q3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PAN2Q504Q3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PAN2Q504Q3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PAN2Q504Q3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PAN2Q504Q3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PAN2Q504Q3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PAN2Q504Q3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PAN2Q504Q3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PAN2Q504Q3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PAN2Q504Q3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PAN2Q504Q3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PAN2Q504Q3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PAN2Q504Q3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PAN2Q504Q3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PAN2Q504Q3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PAN2Q504Q3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PAN2Q504Q3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PAN2Q504Q3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PAN2Q504Q3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PAN2Q504Q3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PAN2Q504Q3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PAN2Q504Q3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PAN2Q504Q3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PAN2Q504Q3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PAN2Q504Q3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PAN2Q504Q3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PAN2Q504Q3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PAN2Q504Q3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms