Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZHG4

FNDC1, Fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC1Q4ZHG4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FNDC1Q4ZHG4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FNDC1Q4ZHG4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FNDC1Q4ZHG4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FNDC1Q4ZHG4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FNDC1Q4ZHG4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FNDC1Q4ZHG4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FNDC1Q4ZHG4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FNDC1Q4ZHG4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FNDC1Q4ZHG4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FNDC1Q4ZHG4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FNDC1Q4ZHG4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FNDC1Q4ZHG4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FNDC1Q4ZHG4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FNDC1Q4ZHG4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FNDC1Q4ZHG4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
FNDC1Q4ZHG4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FNDC1Q4ZHG4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FNDC1Q4ZHG4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FNDC1Q4ZHG4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FNDC1Q4ZHG4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FNDC1Q4ZHG4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FNDC1Q4ZHG4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FNDC1Q4ZHG4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FNDC1Q4ZHG4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FNDC1Q4ZHG4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FNDC1Q4ZHG4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FNDC1Q4ZHG4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FNDC1Q4ZHG4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FNDC1Q4ZHG4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FNDC1Q4ZHG4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FNDC1Q4ZHG4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FNDC1Q4ZHG4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FNDC1Q4ZHG4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FNDC1Q4ZHG4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FNDC1Q4ZHG4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FNDC1Q4ZHG4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FNDC1Q4ZHG4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FNDC1Q4ZHG4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FNDC1Q4ZHG4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FNDC1Q4ZHG4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FNDC1Q4ZHG4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FNDC1Q4ZHG4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FNDC1Q4ZHG4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FNDC1Q4ZHG4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FNDC1Q4ZHG4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FNDC1Q4ZHG4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FNDC1Q4ZHG4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FNDC1Q4ZHG4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FNDC1Q4ZHG4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FNDC1Q4ZHG4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FNDC1Q4ZHG4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FNDC1Q4ZHG4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FNDC1Q4ZHG4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FNDC1Q4ZHG4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
FNDC1Q4ZHG4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
FNDC1Q4ZHG4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FNDC1Q4ZHG4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FNDC1Q4ZHG4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FNDC1Q4ZHG4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FNDC1Q4ZHG4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FNDC1Q4ZHG4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FNDC1Q4ZHG4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FNDC1Q4ZHG4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FNDC1Q4ZHG4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FNDC1Q4ZHG4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FNDC1Q4ZHG4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FNDC1Q4ZHG4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FNDC1Q4ZHG4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FNDC1Q4ZHG4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
FNDC1Q4ZHG4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FNDC1Q4ZHG4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
FNDC1Q4ZHG4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FNDC1Q4ZHG4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
FNDC1Q4ZHG4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FNDC1Q4ZHG4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FNDC1Q4ZHG4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FNDC1Q4ZHG4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FNDC1Q4ZHG4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FNDC1Q4ZHG4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FNDC1Q4ZHG4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FNDC1Q4ZHG4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FNDC1Q4ZHG4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
FNDC1Q4ZHG4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FNDC1Q4ZHG4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FNDC1Q4ZHG4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FNDC1Q4ZHG4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FNDC1Q4ZHG4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FNDC1Q4ZHG4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FNDC1Q4ZHG4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
FNDC1Q4ZHG4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
FNDC1Q4ZHG4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FNDC1Q4ZHG4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FNDC1Q4ZHG4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FNDC1Q4ZHG4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
FNDC1Q4ZHG4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FNDC1Q4ZHG4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FNDC1Q4ZHG4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FNDC1Q4ZHG4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FNDC1Q4ZHG4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms