Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CFAP100Q494V2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CFAP100Q494V2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFAP100Q494V2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFAP100Q494V2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFAP100Q494V2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFAP100Q494V2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CFAP100Q494V2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFAP100Q494V2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFAP100Q494V2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFAP100Q494V2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFAP100Q494V2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFAP100Q494V2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFAP100Q494V2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFAP100Q494V2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFAP100Q494V2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CFAP100Q494V2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFAP100Q494V2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFAP100Q494V2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFAP100Q494V2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFAP100Q494V2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CFAP100Q494V2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFAP100Q494V2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFAP100Q494V2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CFAP100Q494V2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFAP100Q494V2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFAP100Q494V2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFAP100Q494V2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CFAP100Q494V2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFAP100Q494V2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CFAP100Q494V2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFAP100Q494V2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFAP100Q494V2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFAP100Q494V2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFAP100Q494V2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFAP100Q494V2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFAP100Q494V2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFAP100Q494V2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFAP100Q494V2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFAP100Q494V2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFAP100Q494V2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFAP100Q494V2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFAP100Q494V2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFAP100Q494V2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFAP100Q494V2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFAP100Q494V2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFAP100Q494V2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFAP100Q494V2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFAP100Q494V2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CFAP100Q494V2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFAP100Q494V2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFAP100Q494V2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFAP100Q494V2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFAP100Q494V2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFAP100Q494V2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFAP100Q494V2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFAP100Q494V2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFAP100Q494V2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFAP100Q494V2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFAP100Q494V2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFAP100Q494V2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFAP100Q494V2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFAP100Q494V2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFAP100Q494V2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFAP100Q494V2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFAP100Q494V2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFAP100Q494V2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CFAP100Q494V2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CFAP100Q494V2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CFAP100Q494V2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CFAP100Q494V2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CFAP100Q494V2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CFAP100Q494V2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CFAP100Q494V2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CFAP100Q494V2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CFAP100Q494V2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CFAP100Q494V2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CFAP100Q494V2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CFAP100Q494V2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CFAP100Q494V2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CFAP100Q494V2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CFAP100Q494V2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CFAP100Q494V2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CFAP100Q494V2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CFAP100Q494V2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CFAP100Q494V2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFAP100Q494V2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFAP100Q494V2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFAP100Q494V2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFAP100Q494V2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CFAP100Q494V2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CFAP100Q494V2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFAP100Q494V2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFAP100Q494V2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFAP100Q494V2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFAP100Q494V2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFAP100Q494V2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CFAP100Q494V2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFAP100Q494V2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFAP100Q494V2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms