Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BBS9Q3SYG4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BBS9Q3SYG4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BBS9Q3SYG4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BBS9Q3SYG4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BBS9Q3SYG4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BBS9Q3SYG4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BBS9Q3SYG4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BBS9Q3SYG4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BBS9Q3SYG4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BBS9Q3SYG4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BBS9Q3SYG4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BBS9Q3SYG4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BBS9Q3SYG4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BBS9Q3SYG4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BBS9Q3SYG4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
BBS9Q3SYG4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BBS9Q3SYG4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BBS9Q3SYG4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BBS9Q3SYG4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BBS9Q3SYG4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BBS9Q3SYG4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BBS9Q3SYG4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BBS9Q3SYG4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BBS9Q3SYG4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BBS9Q3SYG4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BBS9Q3SYG4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BBS9Q3SYG4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BBS9Q3SYG4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BBS9Q3SYG4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BBS9Q3SYG4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BBS9Q3SYG4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BBS9Q3SYG4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BBS9Q3SYG4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BBS9Q3SYG4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BBS9Q3SYG4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BBS9Q3SYG4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BBS9Q3SYG4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BBS9Q3SYG4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BBS9Q3SYG4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BBS9Q3SYG4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BBS9Q3SYG4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BBS9Q3SYG4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BBS9Q3SYG4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BBS9Q3SYG4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
BBS9Q3SYG4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BBS9Q3SYG4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BBS9Q3SYG4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BBS9Q3SYG4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BBS9Q3SYG4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BBS9Q3SYG4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BBS9Q3SYG4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
BBS9Q3SYG4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BBS9Q3SYG4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BBS9Q3SYG4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BBS9Q3SYG4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BBS9Q3SYG4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BBS9Q3SYG4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BBS9Q3SYG4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BBS9Q3SYG4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BBS9Q3SYG4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BBS9Q3SYG4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BBS9Q3SYG4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BBS9Q3SYG4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BBS9Q3SYG4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BBS9Q3SYG4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BBS9Q3SYG4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BBS9Q3SYG4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BBS9Q3SYG4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BBS9Q3SYG4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BBS9Q3SYG4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BBS9Q3SYG4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BBS9Q3SYG4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BBS9Q3SYG4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BBS9Q3SYG4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BBS9Q3SYG4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BBS9Q3SYG4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BBS9Q3SYG4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BBS9Q3SYG4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BBS9Q3SYG4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BBS9Q3SYG4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BBS9Q3SYG4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BBS9Q3SYG4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BBS9Q3SYG4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BBS9Q3SYG4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BBS9Q3SYG4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BBS9Q3SYG4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BBS9Q3SYG4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BBS9Q3SYG4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BBS9Q3SYG4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BBS9Q3SYG4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BBS9Q3SYG4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BBS9Q3SYG4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BBS9Q3SYG4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BBS9Q3SYG4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BBS9Q3SYG4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BBS9Q3SYG4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BBS9Q3SYG4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BBS9Q3SYG4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
BBS9Q3SYG4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms