Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTLL9Q3SXZ7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTLL9Q3SXZ7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTLL9Q3SXZ7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTLL9Q3SXZ7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTLL9Q3SXZ7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTLL9Q3SXZ7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTLL9Q3SXZ7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTLL9Q3SXZ7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTLL9Q3SXZ7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTLL9Q3SXZ7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTLL9Q3SXZ7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTLL9Q3SXZ7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTLL9Q3SXZ7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTLL9Q3SXZ7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTLL9Q3SXZ7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTLL9Q3SXZ7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTLL9Q3SXZ7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTLL9Q3SXZ7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTLL9Q3SXZ7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTLL9Q3SXZ7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TTLL9Q3SXZ7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTLL9Q3SXZ7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTLL9Q3SXZ7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTLL9Q3SXZ7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTLL9Q3SXZ7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTLL9Q3SXZ7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTLL9Q3SXZ7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTLL9Q3SXZ7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTLL9Q3SXZ7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTLL9Q3SXZ7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTLL9Q3SXZ7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTLL9Q3SXZ7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTLL9Q3SXZ7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTLL9Q3SXZ7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTLL9Q3SXZ7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTLL9Q3SXZ7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTLL9Q3SXZ7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTLL9Q3SXZ7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTLL9Q3SXZ7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTLL9Q3SXZ7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTLL9Q3SXZ7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTLL9Q3SXZ7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TTLL9Q3SXZ7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTLL9Q3SXZ7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTLL9Q3SXZ7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TTLL9Q3SXZ7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TTLL9Q3SXZ7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTLL9Q3SXZ7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTLL9Q3SXZ7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTLL9Q3SXZ7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTLL9Q3SXZ7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTLL9Q3SXZ7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTLL9Q3SXZ7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTLL9Q3SXZ7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTLL9Q3SXZ7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTLL9Q3SXZ7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTLL9Q3SXZ7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTLL9Q3SXZ7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTLL9Q3SXZ7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTLL9Q3SXZ7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTLL9Q3SXZ7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTLL9Q3SXZ7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTLL9Q3SXZ7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTLL9Q3SXZ7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTLL9Q3SXZ7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTLL9Q3SXZ7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTLL9Q3SXZ7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TTLL9Q3SXZ7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTLL9Q3SXZ7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTLL9Q3SXZ7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTLL9Q3SXZ7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTLL9Q3SXZ7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTLL9Q3SXZ7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTLL9Q3SXZ7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TTLL9Q3SXZ7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TTLL9Q3SXZ7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTLL9Q3SXZ7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTLL9Q3SXZ7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TTLL9Q3SXZ7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TTLL9Q3SXZ7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTLL9Q3SXZ7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTLL9Q3SXZ7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTLL9Q3SXZ7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTLL9Q3SXZ7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTLL9Q3SXZ7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTLL9Q3SXZ7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTLL9Q3SXZ7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTLL9Q3SXZ7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTLL9Q3SXZ7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTLL9Q3SXZ7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTLL9Q3SXZ7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTLL9Q3SXZ7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTLL9Q3SXZ7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTLL9Q3SXZ7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTLL9Q3SXZ7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTLL9Q3SXZ7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTLL9Q3SXZ7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTLL9Q3SXZ7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTLL9Q3SXZ7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms