Protein–RNA interactions for Protein: Q33E94

RFX4, Transcription factor RFX4, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX4Q33E94 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFX4Q33E94 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFX4Q33E94 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFX4Q33E94 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFX4Q33E94 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFX4Q33E94 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFX4Q33E94 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFX4Q33E94 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RFX4Q33E94 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFX4Q33E94 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFX4Q33E94 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFX4Q33E94 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFX4Q33E94 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RFX4Q33E94 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RFX4Q33E94 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RFX4Q33E94 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RFX4Q33E94 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFX4Q33E94 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFX4Q33E94 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFX4Q33E94 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFX4Q33E94 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFX4Q33E94 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFX4Q33E94 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFX4Q33E94 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFX4Q33E94 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFX4Q33E94 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFX4Q33E94 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFX4Q33E94 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFX4Q33E94 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFX4Q33E94 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFX4Q33E94 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFX4Q33E94 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFX4Q33E94 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFX4Q33E94 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFX4Q33E94 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFX4Q33E94 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFX4Q33E94 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFX4Q33E94 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFX4Q33E94 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFX4Q33E94 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFX4Q33E94 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RFX4Q33E94 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFX4Q33E94 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFX4Q33E94 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFX4Q33E94 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFX4Q33E94 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFX4Q33E94 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFX4Q33E94 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFX4Q33E94 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFX4Q33E94 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFX4Q33E94 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFX4Q33E94 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFX4Q33E94 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFX4Q33E94 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFX4Q33E94 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFX4Q33E94 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFX4Q33E94 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFX4Q33E94 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFX4Q33E94 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFX4Q33E94 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFX4Q33E94 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFX4Q33E94 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RFX4Q33E94 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFX4Q33E94 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFX4Q33E94 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFX4Q33E94 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
RFX4Q33E94 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
RFX4Q33E94 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFX4Q33E94 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFX4Q33E94 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFX4Q33E94 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFX4Q33E94 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFX4Q33E94 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFX4Q33E94 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFX4Q33E94 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFX4Q33E94 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFX4Q33E94 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFX4Q33E94 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFX4Q33E94 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFX4Q33E94 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFX4Q33E94 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFX4Q33E94 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFX4Q33E94 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RFX4Q33E94 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFX4Q33E94 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFX4Q33E94 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFX4Q33E94 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFX4Q33E94 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX4Q33E94 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX4Q33E94 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX4Q33E94 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX4Q33E94 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX4Q33E94 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX4Q33E94 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX4Q33E94 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX4Q33E94 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX4Q33E94 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX4Q33E94 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX4Q33E94 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFX4Q33E94 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms