Protein–RNA interactions for Protein: Q31612

HLA-B, HLA class I histocompatibility antigen, B-73 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-BQ31612 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-BQ31612 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-BQ31612 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-BQ31612 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-BQ31612 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-BQ31612 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-BQ31612 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-BQ31612 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-BQ31612 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-BQ31612 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-BQ31612 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-BQ31612 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-BQ31612 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-BQ31612 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-BQ31612 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-BQ31612 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-BQ31612 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-BQ31612 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-BQ31612 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-BQ31612 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-BQ31612 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-BQ31612 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-BQ31612 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-BQ31612 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-BQ31612 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-BQ31612 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-BQ31612 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-BQ31612 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-BQ31612 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-BQ31612 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-BQ31612 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-BQ31612 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-BQ31612 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-BQ31612 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-BQ31612 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-BQ31612 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-BQ31612 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-BQ31612 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-BQ31612 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-BQ31612 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-BQ31612 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-BQ31612 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-BQ31612 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-BQ31612 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-BQ31612 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-BQ31612 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-BQ31612 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-BQ31612 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-BQ31612 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-BQ31612 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-BQ31612 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-BQ31612 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-BQ31612 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-BQ31612 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-BQ31612 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-BQ31612 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-BQ31612 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-BQ31612 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-BQ31612 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-BQ31612 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-BQ31612 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-BQ31612 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-BQ31612 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-BQ31612 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-BQ31612 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-BQ31612 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-BQ31612 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-BQ31612 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-BQ31612 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-BQ31612 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-BQ31612 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-BQ31612 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-BQ31612 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-BQ31612 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-BQ31612 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-BQ31612 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-BQ31612 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-BQ31612 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-BQ31612 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-BQ31612 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-BQ31612 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-BQ31612 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-BQ31612 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-BQ31612 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-BQ31612 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-BQ31612 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-BQ31612 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-BQ31612 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-BQ31612 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-BQ31612 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HLA-BQ31612 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HLA-BQ31612 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HLA-BQ31612 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-BQ31612 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-BQ31612 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-BQ31612 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-BQ31612 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-BQ31612 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HLA-BQ31612 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HLA-BQ31612 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms