Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL38Q2WGJ6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL38Q2WGJ6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL38Q2WGJ6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL38Q2WGJ6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL38Q2WGJ6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL38Q2WGJ6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL38Q2WGJ6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL38Q2WGJ6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL38Q2WGJ6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL38Q2WGJ6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL38Q2WGJ6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL38Q2WGJ6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL38Q2WGJ6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL38Q2WGJ6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL38Q2WGJ6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL38Q2WGJ6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL38Q2WGJ6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL38Q2WGJ6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL38Q2WGJ6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL38Q2WGJ6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL38Q2WGJ6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL38Q2WGJ6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL38Q2WGJ6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL38Q2WGJ6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL38Q2WGJ6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL38Q2WGJ6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL38Q2WGJ6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL38Q2WGJ6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL38Q2WGJ6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL38Q2WGJ6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL38Q2WGJ6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL38Q2WGJ6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL38Q2WGJ6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL38Q2WGJ6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL38Q2WGJ6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL38Q2WGJ6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL38Q2WGJ6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL38Q2WGJ6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL38Q2WGJ6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL38Q2WGJ6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL38Q2WGJ6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL38Q2WGJ6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL38Q2WGJ6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL38Q2WGJ6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL38Q2WGJ6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL38Q2WGJ6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL38Q2WGJ6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL38Q2WGJ6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL38Q2WGJ6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL38Q2WGJ6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL38Q2WGJ6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL38Q2WGJ6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL38Q2WGJ6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL38Q2WGJ6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL38Q2WGJ6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL38Q2WGJ6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL38Q2WGJ6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL38Q2WGJ6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL38Q2WGJ6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL38Q2WGJ6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL38Q2WGJ6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL38Q2WGJ6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL38Q2WGJ6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL38Q2WGJ6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL38Q2WGJ6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL38Q2WGJ6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL38Q2WGJ6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL38Q2WGJ6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL38Q2WGJ6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL38Q2WGJ6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL38Q2WGJ6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL38Q2WGJ6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL38Q2WGJ6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL38Q2WGJ6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL38Q2WGJ6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL38Q2WGJ6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL38Q2WGJ6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL38Q2WGJ6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL38Q2WGJ6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KLHL38Q2WGJ6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KLHL38Q2WGJ6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL38Q2WGJ6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL38Q2WGJ6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL38Q2WGJ6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL38Q2WGJ6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL38Q2WGJ6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL38Q2WGJ6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL38Q2WGJ6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL38Q2WGJ6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL38Q2WGJ6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL38Q2WGJ6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL38Q2WGJ6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL38Q2WGJ6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL38Q2WGJ6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL38Q2WGJ6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL38Q2WGJ6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL38Q2WGJ6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL38Q2WGJ6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL38Q2WGJ6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms