Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL98

VMAC, Vimentin-type intermediate filament-associated coiled-coil protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VMACQ2NL98 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VMACQ2NL98 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VMACQ2NL98 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VMACQ2NL98 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VMACQ2NL98 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VMACQ2NL98 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VMACQ2NL98 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VMACQ2NL98 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VMACQ2NL98 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VMACQ2NL98 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VMACQ2NL98 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VMACQ2NL98 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VMACQ2NL98 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VMACQ2NL98 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VMACQ2NL98 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VMACQ2NL98 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VMACQ2NL98 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VMACQ2NL98 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VMACQ2NL98 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VMACQ2NL98 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VMACQ2NL98 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VMACQ2NL98 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VMACQ2NL98 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VMACQ2NL98 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VMACQ2NL98 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VMACQ2NL98 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
VMACQ2NL98 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VMACQ2NL98 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VMACQ2NL98 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VMACQ2NL98 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VMACQ2NL98 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VMACQ2NL98 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VMACQ2NL98 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
VMACQ2NL98 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VMACQ2NL98 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VMACQ2NL98 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VMACQ2NL98 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VMACQ2NL98 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VMACQ2NL98 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VMACQ2NL98 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VMACQ2NL98 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VMACQ2NL98 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VMACQ2NL98 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VMACQ2NL98 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VMACQ2NL98 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VMACQ2NL98 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VMACQ2NL98 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VMACQ2NL98 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VMACQ2NL98 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VMACQ2NL98 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VMACQ2NL98 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VMACQ2NL98 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VMACQ2NL98 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VMACQ2NL98 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VMACQ2NL98 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VMACQ2NL98 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VMACQ2NL98 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VMACQ2NL98 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VMACQ2NL98 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VMACQ2NL98 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VMACQ2NL98 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VMACQ2NL98 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VMACQ2NL98 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VMACQ2NL98 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VMACQ2NL98 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VMACQ2NL98 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VMACQ2NL98 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VMACQ2NL98 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VMACQ2NL98 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VMACQ2NL98 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VMACQ2NL98 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VMACQ2NL98 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VMACQ2NL98 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VMACQ2NL98 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VMACQ2NL98 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VMACQ2NL98 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VMACQ2NL98 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VMACQ2NL98 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VMACQ2NL98 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VMACQ2NL98 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VMACQ2NL98 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VMACQ2NL98 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VMACQ2NL98 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VMACQ2NL98 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
VMACQ2NL98 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VMACQ2NL98 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms