Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB8

LONRF1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, humanhuman

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Length 773 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF1Q17RB8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LONRF1Q17RB8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LONRF1Q17RB8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LONRF1Q17RB8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LONRF1Q17RB8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LONRF1Q17RB8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LONRF1Q17RB8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LONRF1Q17RB8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LONRF1Q17RB8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LONRF1Q17RB8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LONRF1Q17RB8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LONRF1Q17RB8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LONRF1Q17RB8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LONRF1Q17RB8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LONRF1Q17RB8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LONRF1Q17RB8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LONRF1Q17RB8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LONRF1Q17RB8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LONRF1Q17RB8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LONRF1Q17RB8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LONRF1Q17RB8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LONRF1Q17RB8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LONRF1Q17RB8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LONRF1Q17RB8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LONRF1Q17RB8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LONRF1Q17RB8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LONRF1Q17RB8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LONRF1Q17RB8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LONRF1Q17RB8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LONRF1Q17RB8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LONRF1Q17RB8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LONRF1Q17RB8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LONRF1Q17RB8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LONRF1Q17RB8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LONRF1Q17RB8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LONRF1Q17RB8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LONRF1Q17RB8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LONRF1Q17RB8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LONRF1Q17RB8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LONRF1Q17RB8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LONRF1Q17RB8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LONRF1Q17RB8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LONRF1Q17RB8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LONRF1Q17RB8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LONRF1Q17RB8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LONRF1Q17RB8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LONRF1Q17RB8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LONRF1Q17RB8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LONRF1Q17RB8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LONRF1Q17RB8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LONRF1Q17RB8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LONRF1Q17RB8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LONRF1Q17RB8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LONRF1Q17RB8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LONRF1Q17RB8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LONRF1Q17RB8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LONRF1Q17RB8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LONRF1Q17RB8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LONRF1Q17RB8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LONRF1Q17RB8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LONRF1Q17RB8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LONRF1Q17RB8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LONRF1Q17RB8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LONRF1Q17RB8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LONRF1Q17RB8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LONRF1Q17RB8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LONRF1Q17RB8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LONRF1Q17RB8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LONRF1Q17RB8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LONRF1Q17RB8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LONRF1Q17RB8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LONRF1Q17RB8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LONRF1Q17RB8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LONRF1Q17RB8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LONRF1Q17RB8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LONRF1Q17RB8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LONRF1Q17RB8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LONRF1Q17RB8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LONRF1Q17RB8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LONRF1Q17RB8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LONRF1Q17RB8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LONRF1Q17RB8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LONRF1Q17RB8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LONRF1Q17RB8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LONRF1Q17RB8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LONRF1Q17RB8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LONRF1Q17RB8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LONRF1Q17RB8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LONRF1Q17RB8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LONRF1Q17RB8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LONRF1Q17RB8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LONRF1Q17RB8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LONRF1Q17RB8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LONRF1Q17RB8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LONRF1Q17RB8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LONRF1Q17RB8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LONRF1Q17RB8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LONRF1Q17RB8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LONRF1Q17RB8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LONRF1Q17RB8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
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