Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP2B3Q16720 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP2B3Q16720 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP2B3Q16720 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP2B3Q16720 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP2B3Q16720 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP2B3Q16720 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP2B3Q16720 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP2B3Q16720 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP2B3Q16720 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATP2B3Q16720 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATP2B3Q16720 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATP2B3Q16720 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATP2B3Q16720 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATP2B3Q16720 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATP2B3Q16720 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATP2B3Q16720 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP2B3Q16720 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP2B3Q16720 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP2B3Q16720 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP2B3Q16720 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP2B3Q16720 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP2B3Q16720 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP2B3Q16720 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP2B3Q16720 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP2B3Q16720 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP2B3Q16720 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP2B3Q16720 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP2B3Q16720 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP2B3Q16720 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP2B3Q16720 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP2B3Q16720 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP2B3Q16720 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP2B3Q16720 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP2B3Q16720 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP2B3Q16720 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP2B3Q16720 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP2B3Q16720 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP2B3Q16720 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP2B3Q16720 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP2B3Q16720 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP2B3Q16720 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP2B3Q16720 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP2B3Q16720 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP2B3Q16720 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP2B3Q16720 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP2B3Q16720 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP2B3Q16720 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP2B3Q16720 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP2B3Q16720 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP2B3Q16720 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP2B3Q16720 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP2B3Q16720 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP2B3Q16720 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP2B3Q16720 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP2B3Q16720 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP2B3Q16720 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP2B3Q16720 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP2B3Q16720 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP2B3Q16720 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP2B3Q16720 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP2B3Q16720 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP2B3Q16720 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP2B3Q16720 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP2B3Q16720 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP2B3Q16720 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP2B3Q16720 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP2B3Q16720 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP2B3Q16720 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP2B3Q16720 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP2B3Q16720 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP2B3Q16720 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP2B3Q16720 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP2B3Q16720 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP2B3Q16720 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP2B3Q16720 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP2B3Q16720 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP2B3Q16720 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP2B3Q16720 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP2B3Q16720 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP2B3Q16720 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATP2B3Q16720 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATP2B3Q16720 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATP2B3Q16720 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATP2B3Q16720 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATP2B3Q16720 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATP2B3Q16720 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATP2B3Q16720 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATP2B3Q16720 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATP2B3Q16720 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP2B3Q16720 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP2B3Q16720 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP2B3Q16720 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP2B3Q16720 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP2B3Q16720 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP2B3Q16720 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP2B3Q16720 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP2B3Q16720 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP2B3Q16720 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP2B3Q16720 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
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